All conferences

2023

  1. Błażej P., Mackiewicz P., Mackiewicz D. 2023, Simultaneous evolution of primitive coding systems. CA21169 DYNALIFE WG1 Meeting, 80, 70, 20 Conference Towards Excellence and Convergence Research in Theoretical Biology 2-4 May 2023, Venice, Italy. Book of Abstracts pp. 4

  2. Błażej P. 2023, Some theoretical aspects of reprogramming the standard genetic code. CA21169 DYNALIFE WG1 Meeting, Modelling Information Flow in Biological Coding Systems 20-21 June 2023, Belgrade, Serbia. Book of Abstracts pp. 6

  3. Chilimoniuk J., Grzesiak K., Nowakowski D., Krętowski A., Ciborowski M., Burdukiewicz M. 2023, Imputomics: Imputation of missing values for "Omics" data Metabolomics Circle 27-28 January 2023, Wrocław, Poland.

  4. Gagat P., Sidorczuk K., Pietluch F., Ostrówka M., Duda-Madej A., Burdukiewicz M., Seniuk A., Mackiewicz P. 2023, Exploring the relationship between targeting peptides and antimicrobial peptides: insights into evolution and functional implications. The 9th Polish Evolutionary Conference 18-20 September 2023, Kraków, Poland. Program & Abstract pp. 31

  5. Mackiewicz P., Matosiuk M., Świsłocka M., Zachos F., Hajji G. M., Saveljev A. P., Seryodkin I. V., Farahvash T., Rezaei H. R., Torshizi R. V., Mattioli S., Ratkiewicz M. 2023, Filogeneza i ewolucja rodzaju Cervus (Cervidae, Mammalia) odtworzona w oparciu o genomy mitochondrialne. V Warsztaty ”Zróżnicowanie gatunkowe i genetyczne fauny plejstocenu i holocenu w Eurazji” w ramach corocznych spotkań Konsorcjum „Centrum Badań nad Fauną Plejstocenu Europy (CBFPE)” 20-22 wrzesień 2023, Kraków, Polska. Program pp. 17-18

  6. Mackiewicz P. 2023, Analyses of biological issues using various bioinformatic and computational approaches. Lunch Time Seminars, University of Wrocław 30 March 2023, Wrocław, Poland.

  7. Mackiewicz P. 2023, Genomy wymarłych homininów i ewolucja człowieka – nagroda Nobla 2022 Interdyscyplinarne Seminarium Studium Generale Universitatis Wratislaviensis im. Profesora Jana Mozrzymasa 21 marzec 2023, Wrocław, Polska.

  8. Mackiewicz P. 2023, Genomy wymarłych ludzi i ich znaczenie w zrozumieniu naszej ewolucji Piknik naukowy, Uniwersytet Wrocławski 24 wrzesień 2023, Wrocław, Polska.

  9. Mackiewicz P., Baca M., Popović D., Stefaniak K., Socha P., Marciszak A., Urbanowski M., Nadachowski A. 2023, Estimating the extinction time of the cave bear based on radiocarbon dating. VIII Warsztaty Metod Datowania im. Profesora Mieczysława F. Pazdura 19-20 październik 2023, Gliwice, Polska.

  10. Niedziałkowska M., Popović D., Baca M., Gornia J., Chibowski P., Stefaniak K., Sykut M., Ridush B., Ratajczak-Skrzatek U., Ostrówka M., Golubiński M., Mackiewicz P., Suska-Malawska M. 2023, Geographic distribution, phylogeny and habitats of moose since the Late Pleistocene in Eurasia. 13th International Mammalogical Congress & 102nd Annual Meeting of the American Society Of Mammalogists 14-20 July 2023, Anchorage, USA. Conference programme pp. 129

  11. Niedziałkowska M., Popović D., Górny M., Chibowski P., Stefaniak K., Gornia J., Sykut M., Ridush B., Ratajczak-Skrzatek U., Kovalchuk O. M., Ostrówka M., Golubiński M., Mackiewicz P., Suska-Malawska M., Baca M. 2023, Phylogeography and distribution of moose (Alces alces) in Eurasia during the last 50 000 years. 36th Congress of International Union of Game Biologists, Quo vadis wildlife management? The future of wildlife management in the evolving social and environmental realities 28-31 August 2023, Warsaw, Poland. Abstracts pp. 67

  12. Pawłowska K., Alvarez Lao D. J., Croitor R., Dietrich C., van Kolfschoten T., Lister A., Mackiewicz P., Pandolfi L., Stuart A. J., Uzunidis A., Codrea V. 2023, Rhinoceros in Paleolithic art. 20th Congress of the International Union of Prehistoric and Protohistoric Sciences (UISPP) 05-09 September 2023, Timişoara, Romania. UISPP Book of abstracts pp. 154

  13. Pawłowska K., Alvarez Lao D. J., Croitor R., Dietrich C., van Kolfschoten T., Lister A., Mackiewicz P., Pandolfi L., Stuart A. J., Uzunidis A., Codrea V. 2023, Human- animal relation in Pleistocene: narration around the woolly rhinoceros. 4th Palaeontological Virtual Congress 8-22 May 2023, , . Book of Abstracts pp. 204

  14. Pawłowska K., Alvarez Lao D. J., Croitor R., Dietrich C., van Kolfschoten T., Lister A., Mackiewicz P., Pandolfi L., Stuart A. J., Uzunidis A., Codrea V. 2023, Pleistocene woolly rhinoceros skulls: A methodological approach. 21th International Union for Quaternary Congress (INQUA) 13-20 July 2023, Rome, Italy. Abstract book pp. 2816

  15. Pawłowska K., Alvarez Lao D. J., Croitor R., Dietrich C., van Kolfschoten T., Lister A., Mackiewicz P., Pandolfi L., Stuart A. J., Uzunidis A., Codrea V. 2023, Woolly rhinoceros populations in Pleistocene Eurasia: A genetic view. 20th Congress of the International Union of Prehistoric and Protohistoric Sciences (UISPP) 05-09 September 2023, Timişoara, Romania. UISPP Book of abstracts pp. 315

  16. Pietluch F., Mackiewicz P., Gagat P. 2023, New insights into the evolution of complex plastids: unveiling the origins and diversification times of red alga-derived lineages. The 9th Polish Evolutionary Conference 18-20 September 2023, Kraków, Poland. Program & Abstract pp. 32

  17. Pietluch F., Burdukiewicz M., Sidorczuk K., Rafacz D., Bąkała M., Słowik J., Gagat P. 2023, Differentiation anticancer from antimicrobial peptides using Cancergram Antimicrobial Peptides Gordon Research Conference 15-20 January 2023, Lucca, Italy.

  18. Proćków M., Strzała T., Kuźnik-Kowalska E., Żeromska A., Mackiewicz P. 2023, Zmienność morfologiczna i zróżnicowanie genetyczne Trochulus striolatus (Gastropoda: Hygromiidae). XXXVII Krajowe Seminarium Malakologiczne 25-27 maja 2023, Katowice, Polska. Problemy współczesnej malakologii 2023 pp. 45

  19. Sidorczuk K., Gagat P., Kała J., Nielsen H., Pietluch F., Mackiewicz P., Burdukiewicz M. 2023, Where do they come from, where do they go? Prediction of protein subplastid localization and origin with PlastoGram. 27th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology, RECOMB 2023 16-19 April 2023, Istanbul, Turkey.

  20. Sidorczuk K., Gagat P., Pietluch F., Kała J., Rafacz D., Bąkała M., Słowik J., Kolenda R., Rödiger S., Fingerhut L. W., Cooke I. R., Mackiewicz P., Burdukiewicz M. 2023, Benchmarks in antimicrobial peptide prediction are biased due to the selection of negative data. 27th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology, RECOMB 2023 16-19 April 2023, Istanbul, Turkey.

  21. Stefaniak K., Kovalchuk O. M., Ratajczak-Skrzatek U., Kropczyk A., Mackiewicz P., Kłys G., Krajcarz M., Krajcarz M. T., Nadachowski A., Lipecki G., Karbowski K., Ridush B., Sabol M., Płonka T. 2023, Występowanie i rozmieszczenie czwartorzędowych nosorożców z Europy środkowej i wschodniej. V Warsztaty ”Zróżnicowanie gatunkowe i genetyczne fauny plejstocenu i holocenu w Eurazji” w ramach corocznych spotkań Konsorcjum „Centrum Badań nad Fauną Plejstocenu Europy (CBFPE)” 20-22 wrzesień 2023, Kraków, Polska. Program pp. 12

  22. Urantówka A. D., Kroczak A., Mackiewicz P. 2023, Evolution of duplicated regions in mitochondrial genomes of birds (Aves). Conference of Society for Molecular Biology & Evolution, SMBE 2023 23-27 July 2023, Ferrara, Italy. Contributed posters – the abstracts pp. 185

  23. Wnętrzak M., Błażej P., Mackiewicz D., Mackiewicz P. 2023, The minimization of harmful effects of point and frameshift mutations by the standard genetic code. Conference of Society for Molecular Biology & Evolution, SMBE 2023 23-27 July 2023, Ferrara, Italy. Contributed posters – the abstracts pp. 492

  24. Żeromska A., Baca M., Popović D., Lemanik A., Nadachowski A., Mackiewicz P. 2023, The use of ancient DNA (aDNA) analyses to reconstruct the phylogeny and evolution of the northern vole population (Alexandromys oeconomus). Conference of Society for Molecular Biology & Evolution, SMBE 2023 23-27 July 2023, Ferrara, Italy. Contributed posters – the abstracts pp. 362

  25. Żeromska A., Mackiewicz P., Baca M., Popović D., Lemanik A., Fadeeva T., Agadzhanyan A., Horáček I., Rhodes S., Conard N. J., Krajcarz M., Desclaux E., Royer A., Rekovets L., Serdyuk N., Nadachowski A. 2023, Rekonstrukcja filogenezy i ewolucji populacji nornika północnego (Alexandromys oeconomus) V Warsztaty ”Zróżnicowanie gatunkowe i genetyczne fauny plejstocenu i holocenu w Eurazji” w ramach corocznych spotkań Konsorcjum „Centrum Badań nad Fauną Plejstocenu Europy (CBFPE)” 20-22 wrzesień 2023, Kraków, Polska. Program pp. 14-15

2022

  1. Błażej P. 2022, Some theoretical aspects of reprogramming the standard genetic code UWr-HZDR-CASUS International Conference on Advanced Systems Research CASUSCON 11-15 July 2022, Wrocław, Poland. Book of abstracts

  2. Burdukiewicz M., Sidorczuk K., Rafacz D., Pietluch F., Bąkała M., Słowik J., Gagat P. 2022, Differentation anticancer from antimicrobial pepides using Cancergram. UWr-HZDR-CASUS International Conference on Advanced Systems Research CASUSCON 11-15 July 2022, Wrocław, Poland. Book of abstracts

  3. Gagat P., Sidorczuk K., Pietluch F., Ostrówka M., Rafacz D., Kała J., Bąkała M., Słowik J., Chilimoniuk J., Rödiger S., Mackiewicz P., Burdukiewicz M. 2022, Tackling the puzzle of mitochondria and plastid transit peptide evolution from antimicrobial peptides European Molecular Biology Organization EMBO Workshop Comparative genomics of unicellular eukaryotes: Interactions and symbioses 12-17 September 2022, Sant Feliu de Guix, Spain. Abstract Book pp. 110

  4. Gagat P., Sidorczuk K., Pietluch F., Kała J., Rafacz D., Bąkała M., Słowik J., Kolenda R., Chilimoniuk J., Rödiger S., Fingerhut L. W., Cooke I. R., Mackiewicz P., Burdukiewicz M. 2022, Screening proteomes for prediction and design of antimicrobial peptides with AmpGram UWr-HZDR-CASUS International Conference on Advanced Systems Research CASUSCON 11-15 July 2022, Wrocław, Poland. Book of abstracts

  5. Kroczak A., Urantówka A. D., Strzała T., Zaniewicz G., Kurkowski M., Mackiewicz P. 2022, Control regions in mitochondrial genomes from birds of prey (Accipitriformes and Cathartiformes) were duplicated and gradually degenerated during evolution VI Polski Kongres Genetyki, 6th Polish Congress of Genetics 27-30 June 2022, Kraków, Poland. Streszczenia wystąpień i plakatów pp. 190-191

  6. Mackiewicz D., Nowak K., Muniak J., Grzybowska M., Mackiewicz P., Błażej P. 2022, Non-random distribution of dangerous codons in prokaryotic genes VI Polski Kongres Genetyki, 6th Polish Congress of Genetics 27-30 June 2022, Kraków, Poland. Streszczenia wystąpień i plakatów pp. 295

  7. Mackiewicz P. 2022, Zróżnicowanie piżmowoła Ovibos moschatus (Zimmerman, 1780) (Bovidae, Mammalia) w czasie i przestrzeń na podstawie morfometrii czaszki. IV Warsztaty „Zróżnicowanie gatunkowe i genetyczne fauny plejstocenu i holocenu w Eurazji” w ramach corocznych spotkań Konsorcjum „Centrum Badań nad Fauną Plejstocenu Europy (CBFPE)” 25-27 maja 2022, Chęciny, Polska. Program pp. 2

  8. Pietluch F., Mackiewicz P., Sidorczuk K., Gagat P. 2022, Phylogenetic and molecular clock study of plastid encoded genes untangle archaeplastidia evolution Congress of the European Society for Evolutionary Biology ESEB 2022 14-19 August 2022, Prague, Czech Republic. Final Programme pp. 100

  9. Pietluch F., Mackiewicz P., Sidorczuk K., Gagat P. 2022, When did Plastids and Chromatophores Evolve? Phylogenetic and Molecular Clock Studies in the Context of Climatic and Atmospheric Changes European Molecular Biology Organization EMBO Workshop Comparative genomics of unicellular eukaryotes: Interactions and symbioses 12-17 September 2022, Sant Feliu de Guix, Spain. Abstract Book pp. 111

  10. Proćków M., Strzała T., Kuźnik-Kowalska E., Żeromska A., Mackiewicz P. 2022, Effects of climate variables on phenotypes, phylogeographic pattern and distribution of the strawberry snail Trochulus striolatus (Gastropoda: Hygromiidae) World Congress of Malacology 31 July - 5 August 2022, Munich, Germany. Spixiana Zeitschrift fur Zoologie Supplement 30 A pp. 138

  11. Sidorczuk K., Gagat P., Kała J., Nielsen H., Pietluch F., Mackiewicz P., Burdukiewicz M. 2022, Where do they come from, where do they go? Prediction of protein subplastid localization and origin with PlastoGram. 21st European Conference on Computational Biology ECCB 2022 12-21 September 2022, Sitges, Spain. Poster presentations pp. 1937, P197-T

  12. Sidorczuk K., Gagat P., Kała J., Nielsen H., Pietluch F., Mackiewicz P., Burdukiewicz M. 2022, Where do they come from, where do they go? PlastoGram: a stacked model for prediction of protein subplastid localization and origin. German Conference on Bioinformatics GCB 2022 6-8 September 2022, Halle (Salle), Germany. Book of Abstracts pp. 53-54

  13. Sidorczuk K., Gagat P., Kała J., Nielsen H., Pietluch F., Mackiewicz P., Burdukiewicz M. 2022, Where do they come from, where do they go? Prediction of protein subplastid localization and origin with PlastoGram. 7th European Student Council Symposium ESCS 2022 18 September 2022, Sitges, Spain. Program

  14. Wnętrzak M., Błażej P., Mackiewicz D., Mackiewicz P. 2022, Optimization of the standard genetic code in terms of point mutations and frameshifts VI Polski Kongres Genetyki, 6th Polish Congress of Genetics 27-30 June 2022, Kraków, Poland. Streszczenia wystąpień i plakatów pp. 281-282

  15. Żeromska A., Nadachowski A., Baca M., Popović D., Lemanik A., Fadeeva T., Agadzhanyan A., Horáček I., Rhodes S., Conard N. J., Krajcarz M., Desclaux E., Royer A., Rekovets L., Serdyuk N., Mackiewicz P. 2022, A genetic study of the European populations of tundra vole (Alexandromys oeconomus) based on ancient DNA VI Polski Kongres Genetyki, 6th Polish Congress of Genetics 27-30 June 2022, Kraków, Poland. Streszczenia wystąpień i plakatów pp. 209-210

2021

  1. Błażej P., Wnętrzak M., Mackiewicz P. 2021, Theoretical model of genetic code structure evolution Seventh International Conference in Code Biology 31 August – 4 September 2021, Lužnica, Croatia. Abstracts pp. 27

  2. Burdukiewicz M., Sidorczuk K., Gagat P., Pietluch F., Kała J., Rafacz D., Bąkała M., Słowik J., Kolenda R., Rödiger S., Mackiewicz P. 2021, The impact of negative data sampling on antimicrobial peptide prediction German Conference on Bioinformatics GCB 2021 6-9 September 2021, , Online. Programme pp. 7

  3. Burdukiewicz M., Sidorczuk K., Gagat P., Pietluch F., Kała J., Rafacz D., Bąkała M., Słowik J., Kolenda R., Rödiger S., Mackiewicz P. 2021, Negative data set sampling as the source of bias in prediction of antimicrobial peptides XXII Polish Conference on Biocybernetics and Biomedical Engineering (Krajowa Konferencja Biocybernetyki i Inżynierii Biomedycznej) XXII PCBBE 2021 19-21 May 2021, Warsaw, Poland.

  4. Burdukiewicz M., Sidorczuk K., Gagat P., Pietluch F., Kała J., Rafacz D., Słowik J., Kolenda R., Rödiger S., Mackiewicz P. 2021, The impact of negative data sampling on antimicrobial peptides prediction EMBO Young Scientists' Forum 21-22 October 2021, Warsaw, Poland. Abstract book pp. 22

  5. Burdukiewicz M., Gagat P. 2021, AntiViroGram - proteome-wide prediction of antiviral peptide precursors. 30st Annual Meeting of the Society for Virology. Digital conference 24-26 March 2021, , .

  6. Gagat P. 2021, Could mitochondria and plastid transit peptides have evolved from antimicrobial peptides? EMBO Young Scientists' Forum 21-22 October 202, Warsaw, Poland. Abstract book pp. 62

  7. Kozakiewicz D., Barbach A., Rafacz D., Hubicka K., Bąkała M., Lassota A., Stecko J., Szymańska N., Wojciechowski J., Szulc N., Chilimoniuk J., Jęśkowiak I., Nowakowska A., Gąsior-Glogowska M., Kotulska M., Burdukiewicz M. 2021, AmyloGraph: A comprehensive database of amyloid-amyloid interactions Young Scientists' Forum 21-22 October 2021, Warsaw, Poland. Abstract book pp. 90

  8. Mackiewicz P. 2021, Influence of data selection of species distribution modelling Species distribution and ecological niche modelling in R, Physalia Courses 11-15 October 2021, Online, .

  9. Mackiewicz D., Nowak K., Muniak J., Grzybowska M., Mackiewicz P., Błażej P. 2021, Selection against codons prone to nonsense mutations in prokaryotic genes Conference of Society for Molecular Biology & Evolution SMBE 2021 3-8 July 2021, , Online. Abstracts pp. 333

  10. Nowak K., Błażej P., Wnętrzak M., Mackiewicz D., Mackiewicz P. 2021, The Extension of the Standard Genetic Code via Optimal Codon Blocks Division The 14th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies, BIOSTEC 2021 11-13 February 2021, , Online. Final Program and Book of Abstracts, Completet Paper Nr: 4 pp. 29; Proceedings, Volume 3: BIOINFORMATICS, Papers pp. 30-37

  11. Orlińska D., Ratajczak-Skrzatek U., Stefaniak K., Mackiewicz P. 2021, Enamel thickness in two bovids, bison and bos, from Polish caves INQUA-SEQS 2021 Conference “Quaternary Stratigraphy – palaeoenvironment and humans in Eurasia” 13 December 2021, Wrocław, Poland. Proceedings of INQUA-SEQS 2021 Conference pp. 79

  12. Ostrówka M., Gagat P., Duda-Madej A., Burdukiewicz M. 2021, Investigating antibacterial activity of amyloids EMBO Young Scientists' Forum 21-22 October 2021, Warsaw, Poland. Abstract book pp. 104

  13. Pawlak K., Błażej P., Mackiewicz P. 2021, Selection at The Amino Acid Level Can Influence on Synonymous Codon Usage in Alternative Genetic Codes Research in Computational Molecular Biology RECOMB 2021 29 August – 1 September 2021, Padova, Italy.

  14. Pawlak K. 2021, Jak synonimiczne mutacje mogą powodować procesy chorobotwórcze XIII Interdyscyplinarna Konferencja Naukowa TYGIEL 2021 „Interdyscyplinarność kluczem do rozwoju” 25-28 marca 2021, Lublin, Polska. Abstrakty pp. 55

  15. Pawlak K., Błażej P., Mackiewicz P. 2021, Investigation of the influence of selection at the amino acid level on the synonymous codon usage in alternative genetic codes Autumn Conference PTBI 2021 15-17 September 2021, , Online. Book of Abstracts pp. 39

  16. Pawlak K., Błażej P., Mackiewicz P. 2021, The Impact of Selection at The Amino Acid Level on the Synonymous Codon Usage in Alternative Genetic Codes Conference of Society for Molecular Biology & Evolution SMBE 2021 3-8 July 2021, , Online. Abstracts pp. 235

  17. Pietluch F., Sidorczuk K., Mackiewicz P., Gagat P. 2021, Dating the photosynthetic organelle evolution in Archaeplastida, Paulinella and secondary-plastid bearing lineages EMBO Young Scientists' Forum 21-22 October 202, Warsaw, Poland. Abstract book pp. 105

  18. Proćków M., Kuźnik-Kowalska E., Pieńkowska J., Żeromska A., Mackiewicz P. 2021, Speciation processes in sympatric species of land snails from genus Trochulus (Gastropoda, Hygromiidae) inferred from morphological and molecular variation Conference of Society for Molecular Biology & Evolution SMBE 2021 3-8 July 2021, , Online. Abstracts pp. 162

  19. Proćków M., Kuźnik-Kowalska E., Drvotová M., Juřičková L., Proćkow J., Błażej P., Mackiewicz P. 2021, Causes and evolutionary consequences of phenotypic plasticity in land snails of Trochulus hispidus complex 9th European Congress of Malacological Societies Euromal 2021 5-9 September 2021, Praque, Czech Republic. Book of abstracts pp. 77

  20. Sidorczuk K., Burdukiewicz M., Rafacz D., Pietluch F., Bąkała M., Słowik J., Gagat P. 2021, CancerGram: How to differentiate anticancer from antimicrobial peptides? EMBO Young Scientists' Forum 21-22 October 2021, Warsaw, Poland. Abstract book pp. 36

  21. Urantówka A. D., Kroczak A., Mackiewicz P. 2021, New insight on the organization and evolution of Palaeognathae mitogenomes and implications on the ancestral gene rearrangement in Aves Conference of Society for Molecular Biology & Evolution SMBE 2021 3-8 July 2021, , Online. Abstracts pp. 451

  22. Żeromska A., Baca M., Popović D., Lemanik A., Mackiewicz P., Nadachowski A. 2021, Evolutionary history of the tundra vole (Alexandromys oeconomus) in the Late Pleistocene and Holocene ISBA9, online 1-4 July 2021, , .

  23. Żeromska A., Baca M., Popović D., Lemanik A., Fadeeva T., Agadzhanyan A., Horáček I., Rhodes S., Conard N. J., Krajcarz M., Desclaux E., Royer A., Rekovets L., Serdyuk N., Nadachowski A., Mackiewicz P. 2021, Reconstruction the evolutionary history of the tundra vole (Alexandromys oeconomus) based on mitochondrial DNA and radiocarbon dating in the context of climate changes in the late Pleistocene and Holocene Conference of Society for Molecular Biology & Evolution SMBE 2021 3-8 July 2021, , Online. Abstracts pp. 340

2020

  1. Burdukiewicz M., Chilimoniuk J., Sidorczuk K., Pietluch F., Rafacz D., Rödiger S., Gagat P. 2020, AmpGram – a novel tool for prediction of antimicrobial peptides. th Joint Conference of the DGHM & VAAM 8-11 March 2020, Leipzig, Germany. Programme pp. 135

  2. Chilimoniuk J., Gosiewska A., Słowik J., Weiss R., Deckert P. M., Rödiger S., Burdukiewicz M. 2020, Count data analysis with countfitteR Why R? 2020 24-27 September 2020, Warsaw, Poland.

  3. Chilimoniuk J., Gosiewska A., Słowik J., Weiss R., Deckert P. M., Rödiger S., Burdukiewicz M. 2020, countfitteR: count data analysis for precision medicine International Biotech Innovation Days 2020 (IBID) 28-29 October 2020, Senftenberg, Germany.

  4. Gornia J., Chibowski P., Sykut M., Baca M., Popović D., Stefaniak K., Mackiewicz P., Suska-Malawska M., Niedziałkowska M. 2020, Changes in the distribution and habitats of Eurasian moose (Alces alces) during the last 50 000 years. An introduction to the ongoing project Invertebrate and Vertebrate Paleontology day - IVPday 17-20 November 2020, Pisa, Italy. Fossilia

  5. Gornia J., Chibowski P., Sykut M., Baca M., Popović D., Stefaniak K., Mackiewicz P., Suska-Malawska M., Niedziałkowska M. 2020, Filogeografia, zróżnicowanie genetyczne i środowiska występowania łosia w Eurazji w późnym plejstocenie i holocenie XI Konferencja Naukowa Młodzi w Paleontologii "Odkrywając tajemnice minionych er" 27 listopad 2020, Wrocław, Polska. Materiały konferencyjne pp. 10

  6. Mackiewicz P. 2020, Poszukiwanie przodków linii człowieka w oparciu o dane kopalne i molekularne. IV Konferencja Naukowa Odkrywając Paleobiologię, Relacja „człowiek – zwierzę” na tle zmian środowiska przyrodniczego w plejstocenie na obszarze Europy 11 grudzień 2020, Wrocław, Polska.

  7. Orlińska D., Ratajczak-Skrzatek U., Janina U., Stefaniak K., Mackiewicz P. 2020, Preliminary morphometric comparison of molar teeth and their enamel thickness in two bovids, Bison and Bos based od remains found in Polish caves Quaternary Stratigraphy – palaeoenvironment, sediments, palaeofauna and human migrations across Central Europe, INQUA SEQS 2020 28 September 2020, Wroclaw, Poland. Conference Proceedings pp. 93

  8. Orlińska D., Ratajczak-Skrzatek U., Stefaniak K., Mackiewicz P. 2020, Wyniki wstępnej analizy morfometrycznej zębów trzonowych u przedstawicieli rodzaju Bison i Bos ze stanowisk jaskiniowych z terenu Jury krakowsko - Częstochowskiej (Polska) XI Konferencja Naukowa Młodzi w Paleontologii "Odkrywając tajemnice minionych er" 27 listopad 2020, Wrocław, Polska. Materiały konferencyjne pp. 27

  9. Sidorczuk K. 2020, Reproducible analytic workflows in R with drake and renv Data Science Summit, the 4th edition 16 October 2020, Warsaw, Poland.

  10. Sidorczuk K., Burdukiewicz M., Rafacz D., Pietluch F., Chilimoniuk J., Rödiger S., Gagat P. 2020, Prediction of antimicrobial peptides with AmpGram International Biotech Innovation Days 2020 (IBID) 28-29 October 2020, Senftenberg, Germany.

  11. Wnętrzak M., Błażej P., Mackiewicz P. 2020, Properties of the standard genetic code and its alternatives measured by codon usage from corresponding genomes The 13th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies, BIOSTEC 2020 24-26 February 2020, Valletta, Malta. Abstracts, Paper Nr: 24; Proceedings, Volume 3: BIOINFORMATICS, Papers pp. 44-51

  12. Żeromska A. 2020, Czego możemy dowiedzieć się badając antyczny DNA? - Odtworzenie historii ewolucyjnej nornika północnego. IV Konferencja Naukowa Odkrywając Paleobiologię, Relacja „człowiek – zwierzę” na tle zmian środowiska przyrodniczego w plejstocenie na obszarze Europy 11 grudzień 2020, Wrocław, Polska.

  13. Żeromska A., Baca M., Popović D., Lemanik A., Fadeeva T., Agadzhanyan A., Horáček I., Rhodes S., Conard N. J., Krajcarz M., Desclaux E., Royer A., Rekovets L., Serdyuk N., Mackiewicz P., Nadachowski A. 2020, A genetic study of the European populations of tundra vole (Alexandromys oeconomus) based on ancient DNA. 3rd Meeting of the ICAZ Microvertebrate Working Group 1-2 September 2020, Tarragona, Spain. Abstracts book pp. 47

2019

  1. Aloqalaa D. A., Kowalski D. R., Błażej P., Wnętrzak M., Mackiewicz D., Mackiewicz P. 2019, The impact of the transversion/transition ratio on the optimal genetic code graph partition. The 12th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies, BIOSTEC 2019 22-24 February 2019, Praque, Czech Republic. Abstracts, Paper Nr: 17; Proceedings, Volume 3: BIOINFORMATICS, Papers pp. 55-65

  2. Błażej P., Wnętrzak M., Mackiewicz P. 2019, Theoretical model of genetic code structure evolution. Sixth International Conference in Code Biology 3-7 June 2019, Friedrichsdorf, Germany. Abstracts pp. 33

  3. Burdukiewicz M., Sidorczuk K., Pietluch F., Rafacz D., Rödiger S., Gagat P. 2019, Did the targeting signals for mitochondria and plastids evolve from antimicrobial peptides? XII Symposium of Polish Bioinformatics Society 19-21 September 2019, Kraków, Poland. Book of abstracts pp. 62

  4. Burdukiewicz M., Sidorczuk K., Rödiger S., Gagat P. 2019, Did the targeting signals for mitochondria and plastids evolve from ancient antimicrobial peptides? Annual meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution, SMBE 2019 21-25 July 2019, Manchester, United Kingdom. Abstract Book pp. 402

  5. Chilimoniuk J., Burdukiewicz M., Mackiewicz P. 2019, Co-evolution of curli components CsgA and CsgB. The Annual Conference 2019 of the Association for General and Applied Microbiology (Jahrestagung 2019 der Vereinigung für Allgemeine und Angewandte Mikrobiologie), VAAM 17-20 March 2019, Mainz, Germany. Abstracts pp. 152-153

  6. Chilimoniuk J., Burdukiewicz M., Sobczyk P., Rödiger S., Kotulska M., Mackiewicz P. 2019, AmyloGram: the R package and a Shiny server for amyloid prediction. Why R? 2019 Conference 26-29 September 2019, Warszawa, Poland.

  7. Chilimoniuk J., Burdukiewicz M., Sobczyk P., Rödiger S., Kotulska M., Mackiewicz P. 2019, AmyloGram: prediction of amyloid sequences in R. The Conference for users of the R Language satRday, 17-18 May 2019, Gdańsk, Poland. Book of abstracts pp. 14

  8. Chilimoniuk J., Burdukiewicz M., Sobczyk P., Rödiger S., Kotulska M., Mackiewicz P. 2019, AmyloGram: prediction of amyloid sequences in R. EuPA: XIII. Annual Congress of the European Proteomics Association: From Genes via Proteins and their Interactions to Functions 24-28 March 2019, Potsdam, Germany.

  9. Gagat P., Sidorczuk K., Pietluch F., Rödiger S., Burdukiewicz M. 2019, Antimicrobial peptides and the evolution of mitochondria and plastid targeting signals. The 7th Polish Evolutionary Conference (PEC) 18-20 September 2019, Gdańsk, Poland. Programme and abstracts pp. 33

  10. Kotulska M., Burdukiewicz M., Szulc N., Gąsior-Glogowska M., Chilimoniuk J., Mackiewicz P., Sneideris T., Smirnovas V. 2019, How robust are bioinformatical methods to imperfect training data in recognition of amyloid protein aggregates? Amyloid Diseases And Amyloid Mechanisms (ADAM 8) 28-30 August 2019, Lund, Sweden. Book of Abstracts pp. 10

  11. Kuźnik-Kowalska E., Proćków M., Pieńkowska J., Mackiewicz P. 2019, Trochulus hispidus and T. coelomphala interbreed despite distinct genital morphology and genetic differences. World Congress of Malacology 11–16 August 2019, Pacific Grove, CA, USA. Book of Abstracts pp. 253

  12. Kwasniak-Owczarek M., Tomal A., Mackiewicz P., Kazmierczak U., Jańska H. 2019, Identification of sRNAs resembling clustered organellar sRNAs (cosRNAs) in ribo-seq data 11th International Conference for Plant Mitochondrial Biology 10-15 March 2019, Ein Gedi, Israel. Scientific Program pp. 24

  13. Lemanik A., Baca M., Wertz K., Socha P., Popović D., Tomek T., Lipecki G., Miękina B., Żeromska A., Pereswiet-Soltan A., Szyndlar Z., Mackiewicz P., Nadachowski A. 2019, The impact of major warming at ca. 14.7 ka cal BP on environment at local scale (Orawa-Nowy Targ Basin, Western Carpathians, Poland) on the basis of the succession of vertebrate communities. 8th European Congress of Mammalogy, ECM8 23-27 September 2019, Warsaw, Poland. Book of abstracts pp. 190

  14. Lemanik A., Baca M., Wertz K., Socha P., Popović D., Tomek T., Lipecki G., Kraszewska A., Miękina B., Żeromska A., Pereswiet-Soltan A., Szyndlar Z., Cieśla M., Rak K., Skłucki J., Valde-Nowak P., Mackiewicz P., Nadachowski A. 2019, Przemiany zespołów fauny kręgowców i aktywność paleolitycznych populacji ludzkich – rekonstrukcja środowiska przy końcu pleniglacjału (GS-2a) i na początku późnego glacjału (GI-1e) na Podhalu Zebranie naukowe Komisji Paleogeografii Czwartorzędu PAU 18 pażdziernik 2019, Kraków, Polska.

  15. Lemanik A., Baca M., Wertz K., Socha P., Popović D., Tomek T., Lipecki G., Mackiewicz P., Miękina B., Żeromska A., Pereswiet-Soltan A., Szyndlar Z., Nadachowski A. 2019, Wpływ globalnego ocieplenia na początku późnego glacjału (ok. 14700 lat temu) na przemiany fauny i środowiska w skali lokalnej (Kotlina Nowotarska, Karpaty Zachodnie). 4 Warsztaty "Zróżnicowanie gatunkowe i genetyczne fauny plejstocenu i holocenu w Eurazji” w ramach spotkań Konsorcjum "Centrum Badań nad Fauną Plejstocenu Europy (CBFPE)”, Uniwersytet Wrocławski 14-15 maja 2019, Sienna, Stronie Śląskie, Polska. Program pp. 18

  16. Lemanik A., Baca M., Wertz K., Socha P., Popović D., Tomek T., Lipecki G., Kraszewska A., Mackiewicz P., Miękina B., Żeromska A., Pereswiet-Soltan A., Szyndlar Z., Cieśla M., Valde-Nowak P., Nadachowski A. 2019, The impact of major warming that occurred ~14.7 ka cal BP on environmental changes at the local scale (Orawa-Nowy Targ Basin, Western Carpathians, Poland) and the activity of Final Palaeolithic hunters. 3rd Conference World of Gravettian Hunters 20-24 May 2019, Kraków, Poland. Abstracts pp. 43-44

  17. Mackiewicz P., Urantówka A. D., Kroczak A. 2019, Evolution of parrots’ mitochondrial genomes in terms of duplication and its relationships with longevity and body mass. Annual meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution, SMBE 2019 21-25 July 2019, Manchester, United Kingdom. Abstract Book pp. 834

  18. Mackiewicz D., Posacki P., Burdukiewicz M., Błażej P. 2019, The strategy of reproduction and its role in Y chromosome evolution. Annual meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution, SMBE 2019 21-25 July 2019, Manchester, United Kingdom. Abstract Book pp. 324

  19. Niedziałkowska M., Doan K., Sykut M., Górny M., Stefaniak K., Piotrowska N., Jędrzejewska B., Ridush B., Pawełczyk S., Mackiewicz P., Stankovic A. 2019, Ecological niche of red deer (Cervus elaphus) and changes in its range in Europe and the Ural Mountains since the Late Pleistocene. 8th European Congress of Mammalogy, ECM8 23-27 September 2019, Warsaw, Poland. Book of abstracts pp. 115

  20. Niedziałkowska M., Doan K., Sykut M., Górny M., Stefaniak K., Piotrowska N., Jędrzejewska B., Ridush B., Pawełczyk S., Zachos F., Mackiewicz P., Schmölcke U., Kosintsev P., Makowiecki D., Charniauski M., Smith R., Krasnodębski D., Saarma U., Arakelyan M., Manaseryan N., Titov V. V., Hulva P., Balasescu A., Fyfe R., Woodbridge J., Trantalidou K., Pisarenko A., Dimitrijevic V., Wilczyński J., Foronova I., Lipecki G., Arabey A., Stankovic A. 2019, Zasięg i nisza ekologiczna jelenia szlachetnego (Cervus elaphus) w Europie i zachodniej Azji w okresie od późnego plejstocenu do współczesności. 4 Warsztaty "Zróżnicowanie gatunkowe i genetyczne fauny plejstocenu i holocenu w Eurazji” w ramach spotkań Konsorcjum "Centrum Badań nad Fauną Plejstocenu Europy (CBFPE)”, Uniwersytet Wrocławski 14-15 maja 2019, Sienna, Stronie Śląskie, Polska. Program pp. 19

  21. Niedziałkowska M., Popović D., Baca M., Stefaniak K., Sykut M., Chibowski P., Suska-Malawska M., Mackiewicz P. 2019, Phylogeography, genetic diversity and habitat use of moose (Alces alces) in Eurasia in Late Pleistocene and Holocene - introduction to an on-going project. 8th European Congress of Mammalogy, ECM8 23-27 September 2019, Warsaw, Poland. Book of abstracts pp. 191

  22. Pietluch F., Sidorczuk K., Mackiewicz P., Gagat P. 2019, Untangling the puzzle of Archaeplastidia evolution with phylogenies of plastid-encoded proteins. The 7th Polish Evolutionary Conference (PEC) 18-20 September 2019, Gdańsk, Poland. Programme and abstracts pp. 48

  23. Pietluch F., Sidorczuk K., Mackiewicz P., Gagat P. 2019, Phylogenetic analyzes of plastid-encoded proteins untangle the Archaeplastida evolution. XII Symposium of Polish Bioinformatics Society 19-21 September 2019, Kraków, Poland. Book of Abstracts pp. 38

  24. Proćków M., Duda M., Kruckenhauser L., Maassen W. M., de Winter A. J., Mackiewicz P. 2019, Taxonomic status of the western Balkan species Xerocampylaea waldemari (Gastropoda: Hygromiidae: Urticicolini). World Congress of Malacology 11–16 August 2019, Pacific Grove, CA, USA. Book of Abstracts pp. 275

  25. Proćków M., Pieńkowska J., Strzała T., Kuźnik-Kowalska E., Proćkow J., Błażej P., Mackiewicz P. 2019, Factors influencing microevolutionary processes in taxonomically challenging land snail species of Trochulus (Gastropoda: Hygromiidae). World Congress of Malacology 11–16 August 2019, Pacific Grove, CA, USA. Book of Abstracts pp. 150

  26. Proćków M., Duda M., Kruckenhauser L., Maassen W. M., de Winter A. J., Mackiewicz P. 2019, Analizy genetyczne i morfologiczne Xerocampylaea waldemari zapomnianego gatunku z Bałkanów (Gastropoda: Hygromiidae: Urticicolini). XXXV Krajowe Seminarium Malakologiczne 15-17 maj 2019, Szczecin, Polska. Kobak J., Maltz T. K. (red.) Problemy współczesnej malakologii. Bogucki Wydawnictwo Naukowe, Poznań pp. 41-42

  27. Ratajczak U.Urszula , Stefaniak K., Żeromska A., Gagat P., Mackiewicz P. 2019, Differentiation of Pleistocene and recent Saiga in time and space based on morphometric study of cranial remains. 8th European Congress of Mammalogy, ECM8 23-27 September 2019, Warsaw, Poland. Book of abstracts pp. 192

  28. Ratajczak U.Urszula , Stefaniak K., Żeromska A., Gagat P., Mackiewicz P. 2019, Czasowe i przestrzenne zróżnicowanie plejstoceńskiego i współczesnego suhaka w oparciu o analizy morfometryczne czaszki. 4 Warsztaty "Zróżnicowanie gatunkowe i genetyczne fauny plejstocenu i holocenu w Eurazji” w ramach spotkań Konsorcjum "Centrum Badań nad Fauną Plejstocenu Europy (CBFPE)”, Uniwersytet Wrocławski 14-15 maja 2019, Sienna, Stronie Śląskie, Polska. Program pp. 5

  29. Sidorczuk K., Burdukiewicz M., Weinhӓusel A. 2019, Bayesian inference in big data analysis. The Conference for users of the R Language satRday 17-18 May 2019, Gdańsk, Poland. Book of abstracts pp. 21

  30. Sidorczuk K., Pietluch F., Mackiewicz P., Gagat P. 2019, In silico identification and phylogeny of components responsible for protein import into thylakoids of Paulinella photosynthetic species. XII Symposium of Polish Bioinformatics Society 19-21 September 2019, Kraków, Poland. Book of abstracts pp. 39

  31. Sidorczuk K., Burdukiewicz M., Weinhӓusel A. 2019, PepBay: Implementation of Bayesian inference in the analysis of peptide arrays. Why R? 2019 Conference 26-29 September 2019, Warszawa, Poland.

  32. Valde-Nowak P., Nadachowski A., Madeyska T., Łanczont M., Hołub B., Komar M., Mroczek P., Standzikowski K., Kraszewska A., Cieśla M., Skłucki J., Rak K., Lemanik A., Baca M., Wertz K., Socha P., Popović D., Tomek T., Lipecki G., Miękina B., Żeromska A., Pereswiet-Soltan A., Szyndlar Z., Mackiewicz P. 2019, Nowe dane dotyczące środowiska i pradziejów końca pleniglacjału i późnego glacjału w okolicy Jaskini Obłazowej. 53. Sympozjum Speleologiczne 10-13 październik 2019, Szczawnica, Polska. Materiały, streszczenia wystąpień pp. 78-79

  33. Wnętrzak M., Błażej P., Mackiewicz D., Mackiewicz P. 2019, The genetic code structure reflects the impact of different types of translational inaccuracies. The 27th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and the 18th European Conference on Computational Biology, ISMB/ECCB 2019 21-25 July 2019, Basel, Switzerland.

  34. Wnętrzak M., Błażej P., Mackiewicz D., Gagat P., Mackiewicz P. 2019, The standard genetic code is not as robust to amino acid replacements as its many alternative variants. Sixth International Conference in Code Biology 3-7 June 2019, Friedrichsdorf, Germany. Abstracts pp. 20

  35. Żeromska A., Baca M., Popović D., Gagat P., Ratajczak U.Urszula , Stefaniak K., Mackiewicz P. 2019, Wyniki wstępnych analiz genetycznych wymarłych i współczesnych form suhaka. 4 Warsztaty "Zróżnicowanie gatunkowe i genetyczne fauny plejstocenu i holocenu w Eurazji” w ramach spotkań Konsorcjum "Centrum Badań nad Fauną Plejstocenu Europy (CBFPE)”, Uniwersytet Wrocławski 14-15 maja 2019, Sienna, Stronie Śląskie, Polska. Program pp. 6

2018

  1. Bielecki M., Antonyuk S., Strange R. W., Smalley J. W., Śmiga M., Stępień P., Mackiewicz P., Noceń P., Olczak M., Olczak T. 2018, Porphyromonas gingivalis HmuY and Tannerella forsythia Tfo - two homologous proteins with different heme-binding properties The 43rd FEBS Congress , Prague, Czech Republic. Febs Open Bio 8 pp. 428

  2. Bielecki M., Antonyuk S., Strange R. W., Smalley J. W., Śmiga M., Stępień P., Mackiewicz P., Noceń P., Olczak M., Olczak T. 2018, Prevotella intermedia produces two homologous proteins to Porphyromonas gingivalis HmuY with different heme-binding properties The 43rd FEBS Congress 7-12 July 2018, Prague, Czech Republic. Febs Open Bio 8 pp. 429

  3. Błażej P., Wnętrzak M., Mackiewicz P. 2018, The Importance of Changes Observed in the Alternative Genetic Codes. The 11th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies, BIOSTEC 2018 19-21 January 2018, Funchal, Madeira, Portugal. Final Program and Book of Abstracts: pp. 101; Proceedings, Papers pp. 154-159
    [Download]

  4. Błażej P. 2018, The structure of the genetic code as an optimal graph clustering problem Fifth International Conference in Code Biology 5-9 June 2018, Granada, Spain. Abstracts pp. 29

  5. Błażej P., Mackiewicz D., Wnętrzak M., Mackiewicz P. 2018, The influence of selection at the amino acid level on the usage of synonymous codons XI Symposium of Polish Bioinformatics Society 5-7 September 2018, Wrocław, Poland. Book of abstracts pp. 61

  6. Błażej P., Kowalski D. R., Mackiewicz D., Wnętrzak M., Aloqalaa D. A., Mackiewicz P. 2018, The structure of the genetic code as an optimal graph clustering problem XI Symposium of Polish Bioinformatics Society 5-7 September 2018, Wrocław, Poland. Book of abstracts pp. 35

  7. Burdukiewicz M., Gagat P., Jabłoński S., Chilimoniuk J., Gaworski M., Mackiewicz P., Łukaszewicz M. 2018, PhyMet2: complex database containing records on methanogens with unique feature (MethanoGram) allowing prediction of culture conditions based on 16S rRNA. Annual Conference 2018 of the Association for General and Applied Microbiology 15-18 April 2018, Wolfsburg, Germany. Abstracts pp. 131

  8. Burdukiewicz M., Chilimoniuk J., Spiess A., Rödiger S. 2018, PCRedux: machine learning helper tool for sigmoid curves. PL in ML: Polish View on Machine Learning 14-17 December 2018, Warsaw, Poland.

  9. Burdukiewicz M., Spiess A., Rödiger S. 2018, predPCR: automated classification of sigmoid curves. XI Symposium of Polish Bioinformatics Society 5-7 September 2018, Wrocław, Poland. Book of abstracts pp. 16

  10. Burdukiewicz M., Gagat P., Jabłoński S., Chilimoniuk J., Gaworski M., Mackiewicz P., Łukaszewicz M. 2018, PhyMet2: database and algorithm predicting culturing conditions of methanogens International Biotech Innovation Days 23-25 May 2018, Senftenberg, Germany.

  11. Chilimoniuk J., Burdukiewicz M., Sobczyk P., Rödiger S., Duda-Madej A., Gąsior-Głogowska M., Kotulska M., Mackiewicz P. 2018, AmyloGram: prediction of amyloid sequences in R. PL in ML: Polish View on Machine Learning 14-17 December 2018, Warsaw, Poland.

  12. Chilimoniuk J., Burdukiewicz M., Gagat P., Jabłoński S., Gaworski M., Mackiewicz P., Łukaszewicz M. 2018, PhyMet2: a database and toolkit for phylogenetic and metabolicanalyses of methanogens. XI Symposium of Polish Bioinformatics Society 5-7 September 2018, Wrocław, Poland. Book of abstracts pp. 18

  13. Chilimoniuk J., Mackiewicz P., Burdukiewicz M. 2018, CsgA, CsgB and CsgC - Evolutionary Interplay in Curli biogenesis 8th ASM Conference on Biofilms 7-11 October 2018, Washington DC, USA. Book of Abstracts pp. 102

  14. Cysewski D., Dąbrowska K., Burdukiewicz M., Chilimoniuk J., Dadlez M. 2018, HDX at single residue resolution reveals principles of aggregation of functional amyloids The 17th World Congress of the Human Proteome Organization (HUPO) 30 September - 3 October 2018, Orlando, Florida, USA.

  15. Gagat P., Burdukiewicz M., Sidorczuk K., Mackiewicz P. 2018, Import of nuclear-­‐encoded proteins into the photosynthetic organelles of Paulinella. The 6th Polish Evolutionary Conference 26-28 September 2018, Warsaw, Poland. Book of Abstracts pp. 18

  16. Gagat P., Burdukiewicz M., Sidorczuk K., Mackiewicz P. 2018, Protein import into the photosynthetic organelles of Paulinella species Mitochondria and Chloroplasts Gordon Research Conference 8-13 July 2018 , Lucca (Barga), Italy.

  17. Kozakiewicz D., Chilimoniuk J., Lassota A., Sikorska J., Mackiewicz P., Mackiewicz D., Burdukiewicz M. 2018, Regulation of biofilm growth. International Biotech Innovation Days 23-25 May 2018, Senftenberg, Germany.

  18. Kroczak A., Urantówka A. D., Mackiewicz P. 2018, Bioinformatic analyses of mitochondrial genomes show duplicated regions in many parrot taxa XI Symposium of Polish Bioinformatics Society 5-7 September 2018, Wrocław, Poland. Book of abstracts pp. 29

  19. Lassota A., Chilimoniuk J., Kozakiewicz D., Sikorska J., Mackiewicz P., Mackiewicz D., Burdukiewicz M. 2018, Selective inhibition of biofilm-associated amyloids. International Biotech Innovation Days 23-25 May 2018, Senftenberg, Germany.

  20. Mackiewicz P., Urantówka A. D., Kroczak A. 2018, Efficiency of tree constructed methods and mitochondrial markers on inferring phylogenetic relationships in the example of parrots. 17th European Conference on Computational Biology, ECCB 2018 8-12 September 2018, Athens, Greece. Programme pp. 13

  21. Mackiewicz D., Posacki P., Burdukiewicz M., Błażej P. 2018, New insights in Y chromosome degeneration XI Symposium of Polish Bioinformatics Society 5-7 September 2018, Wrocław, Poland. Book of abstracts pp. 26

  22. Mackiewicz D., Wnętrzak M., Błażej P., Mackiewicz P. 2018, Optimization of the standard genetic code in terms of to three codon positions using an evolutionary algorithm. 17th European Conference on Computational Biology, ECCB 2018 8-12 September 2018, Athens, Greece. Programme pp. 15

  23. Niedzielska N., Gąsior-Głogowska M., Burdukiewicz M., Kotulska M. 2018, To uncover what is hidden — studying amyloidogenic propensity XI Symposium of Polish Bioinformatics Society 5-7 September 2018, Wrocław, Poland. Book of abstracts pp. 52

  24. Pietluch F., Gagat P., Mackiewicz P. 2018, In search of primary plastids' origin XI Symposium of Polish Bioinformatics Society 5-7 September 2018, Wrocław, Poland. Book of abstracts pp. 77

  25. Popović D., Baca M., Ridush B., Stefaniak K., Gagat P., Mackiewicz P. 2018, Sekwencjonowanie genomu Equus hydruntinus ze stanowiska Emine-Bair Khosar II Warsztaty "Zróżnicowanie gatunkowe i genetyczne fauny plejstocenu i holocenu w Eurazji” w ramach spotkań Konsorcjum "Centrum Badań nad Fauną Plejstocenu Europy (CBFPE)”, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego 22-23 maja 2018, Warszawa, Polska.

  26. Popović D., Baca M., Stefaniak K., Socha P., Marciszak A., Lipecki G., Nadachowski A., Sabol M., Ridush B., Roblíčková M., Káňa V., Obada T., Stankovic A., Mackiewicz P. 2018, Analizy filogenetyczne niedźwiedzia jaskiniowego ze szczególnym uwzględnieniem prób z terenów Polski i krajów ościennych II Warsztaty "Zróżnicowanie gatunkowe i genetyczne fauny plejstocenu i holocenu w Eurazji” w ramach spotkań Konsorcjum "Centrum Badań nad Fauną Plejstocenu Europy (CBFPE)”, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego 22-23 maja 2018, Warszawa, Polska.

  27. Proćków M., Kuźnik-Kowalska E., Proćkow J., Błażej P., Mackiewicz P. 2018, Plastyczność fenotypowa Trochulus hispidus (Linnaeus, 1758) i jej znaczenie ewolucyjne. XXXIV Krajowe Seminarium Malakologiczne 13-15 września 2018, Toruń, Polska. Streszczenia pp. 57-58

  28. Sidorczuk K., Mackiewicz P., Gagat P. 2018, Protein import into the chromatophores of Paulinella photosynthetic species. International Biotech Innovation Days 23-25 May 2018, Senftenberg, Germany.

  29. Sidorczuk K., Burdukiewicz M., Weinhӓusel A. 2018, PepBay: a Bayesian framework for analysis of peptide arrays. PL in ML: Polish View on Machine Learning 14-17 December 2018, Warsaw, Poland.

  30. Sidorczuk K., Burdukiewicz M., Mackiewicz P., Gagat P. 2018, Two protein import pathways into the cyanobacteria-derived, photosynthetic organelles of Paulinella chromatophora XI Symposium of Polish Bioinformatics Society 5-7 September 2018, Wrocław, Poland. Book of abstracts pp. 80

  31. Sikorska J., Chilimoniuk J., Lassota A., Kozakiewicz D., Mackiewicz P., Mackiewicz D., Burdukiewicz M. 2018, Amyloidic scaffolds in biofilms. International Biotech Innovation Days 23-25 May 2018, Senftenberg, Germany.

  32. Wnętrzak M., Błażej P., Mackiewicz P. 2018, The standard genetic code robustness to both point and frameshift mutations XI Symposium of Polish Bioinformatics Society 5-7 September 2018, Wrocław, Poland. Book of abstracts pp. 28

  33. Wnętrzak M., Błażej P., Mackiewicz P. 2018, Robustness of the standard genetic code to mutations and mistranslations regarding various amino acid properties Fifth International Conference in Code Biology 5-9 June 2018, Granada, Spain. Abstracts pp. 17

  34. Wnętrzak M., Błażej P., Mackiewicz P. 2018, Studying robustness of the standard genetic code to various types of mutations. 17th European Conference on Computational Biology, ECCB 2018 8-12 September 2018, Athens, Greece. Programme pp. 15

2017

  1. Błażej P., Gagat P., Wnętrzak M., Mackiewicz P. 2017, Study on the properties of alternative genetic codes in comparison with the canonical genetic code and theoretical codon assignments. The 25th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and the 16th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB) 21-25 July 2017, Prague, Czech Republic.
    [Download]

  2. Błażej P., Gagat P., Wnętrzak M., Mackiewicz P. 2017, Properties of alternative genetic codes in comparison with the canonical genetic code and theoretical codon assignments. X Symposium of the Polish Bioinformatics Society 27-29 September 2017, Uniejów, Poland. Book of abstracts pp. 41

  3. Burdukiewicz M. 2017, Predicting properties of biological sequences using n-gram analysis. Wrocław Biofilm Symposium. Amyloidic origins of biofilms - from formation to dispersion. 9-10 October 2017, Wrocław, p.

  4. Burdukiewicz M., Rödiger S., Gąsior-Głogowska M., Mackiewicz P., Kotulska M. 2017, Computational and experimental validation of amyloid databases. The 25th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and the 16th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB) 21-25 July 2017, Prague, Czech Republic.
    [Download]

  5. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Mackiewicz P., Spiess A., Rödiger S. 2017, Integrated analysis of digital PCR experiments in R. The R User Conference, useR! 2017 4-7 July 2017, Brussels, Belgium. Book of Contributed Abstracts pp. 114

  6. Burdukiewicz M., Hugget J., Whale A., Fehse B., Sobczyk P., Mackiewicz P., Spiess A., Schierack P., Rödiger S. 2017, dpcReport: web server and software suite for unified analysis of digital PCRs and digital assays. 8th qPCR, dPCR & NGS Symposium 3-5 April 2017, Freising, Germany.

  7. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Rödiger S., Duda-Madej A., Gąsior-Głogowska M., Mackiewicz P., Kotulska M. 2017, AmyloGram: prediction of amyloid sequences in R. The R User Conference, useR! 2017 4-7 July 2017, Brussels, Belgium. Book of Contributed Abstracts pp. 275

  8. Burdukiewicz M., Rödiger S., Gąsior-Głogowska M., Mackiewicz P., Kotulska M. 2017, Challenges in the computational prediction of peptide amyloidogenicity. 3rd NGP-Net Symposium on non-globular proteins 28 August - 1 September 2017 , Košice, Slovakia. Book of Abstracts pp. 85

  9. Kotulska M., Woźniak P. P., Burdukiewicz M., Kulbacka J. 2017, Modeling motifs and transmembrane properties of amyloid proteins. 3rd NGP-Net Symposium on non-globular proteins 28 August - 1 September 2017 , Košice, Slovakia. Book of Abstracts pp. 91-92

  10. Mackiewicz P., Baca M., Popović D., Stefaniak K., Marciszak A., Urbanowski M., Nadachowski A. 2017, Szacowanie czasów wymarcia niedźwiedzi jaskiniowych, Ursus ingressus i U. spelaeus. Warsztaty "Zróżnicowanie gatunkowe i genetyczne fauny plejstocenu i holocenu w Eurazji” w ramach spotkań Konsorcjum "Centrum Badań nad Fauną Plejstocenu Europy (CBFPE)”, Instytut Biologii Ssaków Polskiej Akademii Nauk 17-19 maj 2017, Białowieża, Polska.

  11. Mackiewicz P., Błażej P., Mackiewicz D., Grabińska M., Wnętrzak M. 2017, Costs of amino acid replacement can be minimized by mutational pressure in bacterial genomes. X Symposium of the Polish Bioinformatics Society 27-29 September 2017, Uniejów, Poland. Book of abstracts pp. 69

  12. Mackiewicz D., Posacki P., Burdukiewicz M., Błażej P. 2017, The problem of recombination suppression in evolution of sex chromosomes. The 25th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and the 16th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB) 21-25 July 2017, Prague, Czech Republic.
    [Download]

  13. Mackiewicz P. 2017, Importance of biofilms Wrocław Biofilm Symposium. Amyloidic origins of biofilms - from formation to dispersion. 9-10 October 2017, Wrocław, Poland.

  14. Mackiewicz P., Błażej P., Grabińska M., Wnętrzak M., Mackiewicz D. 2017, Optimization of mutational pressure in bacterial genomes according to costs of amino acid replacement. The 25th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and the 16th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB) 21-25 July 2017, Prague, Czech Republic.
    [Download]

  15. Popović D., Baca M., Gagat P., Mackiewicz P., Ridush B., Stefaniak K. 2017, Genomic data of an extinct equid Equus hydruntinus from Crimea – preliminary results The 23rd International Cave Bear Symposium 4-7 October 2017, Liptovsky Mikulas, Slovakia.

  16. Proćków M., Kuźnik-Kowalska E., Mackiewicz P. 2017, Two distinct forms of the hairy snail Trochulus hispidus (Linnaeus, 1758) show great phenotypic plasticity and no barriers in reproduction. EUROMAL, 8th European Congress of Malacological Societies 10-14 September 2017, Kraków, Polska. Book of Abstracts pp. 107

  17. Proćków M., Pieńkowska J., Kuźnik-Kowalska E., Mackiewicz P. 2017, Is the true identity of Trochulus coelomphala (Gastropoda: Hygromiidae) possible? EUROMAL, 8th European Congress of Malacological Societies 10-14 September 2017, Kraków, Polska. Book of abstracts pp. 73

  18. Rabiniak E., Strzała T., Rekovets L., Mackiewicz P. 2017, Analiza kopalnego DNA rodzajów Lepus i Ochotona (Lagomorpha, Mammalia) z plejstocenu i holocenu Europy. Warsztaty "Zróżnicowanie gatunkowe i genetyczne fauny plejstocenu i holocenu w Eurazji” w ramach spotkań Konsorcjum "Centrum Badań nad Fauną Plejstocenu Europy (CBFPE)”, Instytut Biologii Ssaków Polskiej Akademii Nauk 17-19 maj 2017, Białowieża, Polska.

  19. Ridush B., Doan K., Mackiewicz P., Stefaniak K., Węgleński P., Stankovic A. 2017, Population history of Cervus elaphus in Crimea (Artiodactyla: Cervidae). Populations in the Non-Optimal Environment, INQUA International Field Workshop 20-23 September 2017, Chernivtsi – Neporotove – Borshchiv, Ukraine. Absrtract Book pp. 13

  20. Sobczyk P., Lauber C., Mackiewicz P., Burdukiewicz M. 2017, biogram: n-gram analysis of biological sequences in R. The R User Conference, useR! 2017 4-7 July 2017, Brussels, Belgium. Book of Contributed Abstracts pp. 285

  21. Stefaniak K., Mackiewicz P., Semba A., Ratajczak U.Urszula , Wojtal P., Shpansky A. V., Malikov D. G., Krakhmalnaya T. V., Kovalchuk O. M., Boeskorov G. G., Nikolskiy P. A., Baca M., Popović D., Pawłowska K., Jakubowski G., Roblíčkova M., Nadachowski A. 2017, Spatial-temporal distribution and morphometric differentiation of musk ox Ovibos moschatus ZIMMERMAN, 1870 from Eurasia. Populations in the Non-Optimal Environment, INQUA International Field Workshop 20-23 September 2017, Chernivtsi – Neporotove – Borshchiv, Ukraine. Absrtract Book pp. 15

  22. Wnętrzak M., Błażej P., Grabińska M., Mackiewicz P. 2017, Representations of Markov processes in biological optimization problems. Gdańsk Summer School of Advanced Science on Algorithms for Discrete Optimization 5-12 September 2017, Gdańsk, Poland.

  23. Wnętrzak M., Błażej P., Grabińska M., Mackiewicz P. 2017, Representations of Markov processes in biological optimization problems. The 25th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and the 16th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB), 21-25 July 2017, Prague, The Czech Republic.
    [Download]

  24. Wnętrzak M., Błażej P., Mackiewicz P. 2017, The Application of Multi-objective Approach in the Optimization of the Genetic Code. X Symposium of the Polish Bioinformatics Society 27-29 September 2017, Uniejów, Poland. Book of abstracts pp. 42

2016

  1. Baca M., Popović D., Stefaniak K., Marciszak A., Urbanowski M., Nadachowski A., Mackiewicz P. 2016, Estimation of cave bear extinction including the youngest specimen confirmed genetically. The 22nd International Cave Bear Symposium 21-25 September 2016, Kletno, Polska. Programme and abstracts pp. 19-20

  2. Baca M., Popović D., Stefaniak K., Marciszak A., Urbanowski M., Nadachowski A., Mackiewicz P. 2016, Datowanie czasu wymarcia niedźwiedzia jaskiniowego uwzględniając najmłodsze szczątki potwierdzone genetycznie sugeruje jego przetrwanie w północnym refugium. Spotkanie Konsorcjum "Centrum Badań nad Fauną Plejstocenu Europy” (CBFPE), Uniwersytet Wrocławski, Zakład Paleozoologii 18-19 luty 2016, Wrocław, Polska.

  3. Błażej P., Wnętrzak M., Mackiewicz D., Mackiewicz P. 2016, Selection at the amino acid level influences the synonymous codons usage bias. The 9th Symposium of the Polish Bioinformatics Society 28-30 September 2016, Białystok, Polska.

  4. Błażej P., Wnętrzak M., Mackiewicz D., Mackiewicz P. 2016, Selection at the amino acid level as one of the forces behind the synonymous codons usage bias. German Conference on Bioinformatics GCB 2016 12-15 September 2016, Berlin, Germany. The Guide to GCB 2016 pp. 193

  5. Błażej P., Wnętrzak M., Mackiewicz P. 2016, The impact of the crossover operator on the results of evolutionary-based algorithms in the problem of the genetic code optimization. BioInformatics in Toruń – BIT16 16-18 June 2016, Toruń, Polska. Book of Abstracts pp. 59

  6. Błażej P., Wnętrzak M., Mackiewicz D., Mackiewicz P. 2016, The influence of selection at the amino acid level on the synonymous codons usage. European Conference on Computational Biology ECCB 2016 3-7 September 2016, Hague, Netherlands. Abstracts Genomes pp. 9

  7. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Rödiger S., Mackiewicz P., Kotulska M. 2016, AmyloGram: a novel predictor of amyloidogenicity. European Conference on Computational Biology ECCB 2016 3-7 September 2016, Hague, Netherlands. Abstracts Proteins pp. 1

  8. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Rödiger S., Duda-Madej A., Mackiewicz P., Kotulska M. 2016, AmyloGram: analysis and prediction of amyloids using n-grams. Congress of the Polish Biochemistry, Cell Biology, Biophysics and Bioinformatics BIO 2016 13–16 September 2016, Wrocław, Polska. Acta Biochimica Polonica, Supplement 2, 2016, Abstracts of the BIO 2016 Congress pp. 164

  9. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Mackiewicz P., Rödiger S. 2016, dpcR: web server and R package for analysis of digital PCR experiments. Innovation Forum Senftenberg 1-2 June 2016, Senftenberg, Germany.
    [Download]

  10. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Błażej P., Mackiewicz P. 2016, SignalHsmm: prediction of malarial signal peptides. The 9th Symposium of the Polish Bioinformatics Society 28-30 September 2016, Białystok, Polska.

  11. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Rödiger S., Duda-Madej A., Mackiewicz P., Kotulska M. 2016, Prediction of amyloidogenicity based on the n-gram analysis. German Conference on Bioinformatics GCB 2016 12-15 September 2016, Berlin, Germany. The Guide to GCB 2016 pp. 65-74

  12. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Rödiger S., Mackiewicz P., Kotulska M. 2016, AmyloGram: a novel predictor of amyloidogenicity. European Student Council Symposium ESCS 2016 3 September 2016, Hague, Netherlands. Abstracts pp. 7

  13. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Mackiewicz P., Kotulska M. 2016, AmyloGram: n-gram analysis of amyloids. BioInformatics in Toruń – BIT16 16-18 June 2016, Toruń, Polska. Book of Abstracts pp. 24

  14. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Mackiewicz P. 2016, Biogram: standardization of biological n-gram analysis in R. The CHARME of standardisation in life sciences 21-22 June 2016, Warsaw, Polska. Abstracts pp. 20-21

  15. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Błażej P., Mackiewicz P. 2016, Prediction of malarial signal peptides. German Conference on Bioinformatics GCB 2016 12-15 September 2016, Berlin, Germany. The Guide to GCB 2016 pp. 270

  16. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Kotulska M., Mackiewicz P. 2016, N-gram analysis of biological sequences in R. European R Users Meeting eRum 2016 12-14 October 2016, Poznań, Polska. Book of Abstracts pp. 64

  17. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Kotulska M., Mackiewicz P. 2016, Biogram: a toolkit for biological n-gram analysis. Innovation Forum Senftenberg 1-2 June 2016, Senftenberg, Germany.
    [Download]

  18. Doan K., Mackiewicz P., Sandoval-Castellanos E., Stefaniak K., Ridush B., Dalen L., Węgleński P., Stankovic A. 2016, Wpływ zmian klimatycznych i działalności człowieka na ewolucję jeleni w plejstocenie i holocenie z uwzględnieniem nowych szczątków kopalnych z Krymu. Spotkanie Konsorcjum "Centrum Badań nad Fauną Plejstocenu Europy” (CBFPE), Uniwersytet Wrocławski, Zakład Paleozoologii 18-19 luty 2016, Wrocław, Polska.

  19. Gagat P., Bodył A., Mackiewicz P. 2016, Import of nuclear-encoded proteins into the photosynthetic organelles of Paulinella chromatophora. The 13th International Colloquium on Endocytobiology and Symbiosis, ICES 2016 10-16 September 2016, Kyoto, Japan. Program Book pp. 32

  20. Kramer T., Rödiger S., Böhm A., Nitschke J., Burdukiewicz M., Menschikowski M., Lehmann W. 2016, Absolute Quantification of Nucleic Acids on a Planar Droplet Digital PCR Array Innovation Forum Senftenberg 1-2 June 2016, Senftenberg, Germany.
    [Download]

  21. Kuźnik-Kowalska E., Strzała T., Mackiewicz P., Proćków M., Pokryszko B. 2016, Molekularna analiza filogeograficzna Discus perspectivus (Megerle von Muehlfeld, 1818). XXXII Krajowe Seminarium Malakologiczne 13-15 październik 2016 , Spała, Polska. Maltz TK, Kałuski T, Sulikowska-Drozd A (red.) Problemy współczesnej malakologii. Bogucki Wydawnictwo Naukowe, Poznań pp. 42

  22. Mackiewicz D. 2016, The influence of chromosome position on human gene evolution The 5th Polish Congress of Genetics 19-22 September.2016, Łódź, Polska. Program i materiały kongresowe pp. 194

  23. Niedziałkowska M., Stankovic A., Doan K., Stefaniak K., Sykut M., Piotrowska N., Pawełczyk S., Mackiewicz P., Jędrzejewska B. 2016, Zróżnicowanie genetyczne i wybiórczość środowiskowa jelenia szlachetnego (Cervus elaphus) w Europie i Azji w późnym plejstocenie i holocenie. Spotkanie Konsorcjum "Centrum Badań nad Fauną Plejstocenu Europy” (CBFPE), Uniwersytet Wrocławski, Zakład Paleozoologii 18-19 luty 2016, Wrocław, Polska.

  24. Pawlik K., Mackiewicz P., Kotowska M., Tobiasz A., Kozub K., Korzeniowska-Kowal A. 2016, Microbiological Resources and Bioinformatic Tools at MultiGenBank Database. Congress of the Polish Biochemistry, Cell Biology, Biophysics and Bioinformatics BIO 2016 13–16 September 2016, Wrocław, Polska. Acta Biochimica Polonica, Supplement 2, 2016, Abstracts of the BIO 2016 Congress pp. 170

  25. Popović D., Baca M., Stefaniak K., Lipecki G., Nadachowski A., Marciszak A., Sabol M., Ridush B., Roblíčková M., Káňa V., Obada T., Stankovic A., Mackiewicz P. 2016, Genetic studies of cave bear (Ursus ingressus) populations from Central and Eastern Europe. Spotkanie Konsorcjum "Centrum Badań nad Fauną Plejstocenu Europy” (CBFPE), Uniwersytet Wrocławski, Zakład Paleozoologii 18-19 luty 2016, Wrocław, Polska.

  26. Popović D., Baca M., Stefaniak K., Lipecki G., Nadachowski A., Marciszak A., Sabol M., Ridush B., Roblíčková M., Káňa V., Obada T., Mackiewicz P. 2016, Phylogeography of cave bear (Ursus ingressus) from Central and Eastern Europe based on ancient DNA. The 22nd International Cave Bear Symposium 21-25 September 2016, Kletno, Polska. Programme and abstracts pp. 31-32

  27. Posacki P., Mackiewicz D., Mackiewicz P. 2016, The influence of sex determination system and faithfulness of pairs on sex chromosome evolution The 5th Polish Congress of Genetics 19-22 September.2016, Łódź, Polska. Program i materiały kongresowe pp. 273

  28. Proćków M., Kuźnik-Kowalska E., Mackiewicz P. 2016, Plastyczność fenotypowa i brak barier rozrodczych między dwoma morfologicznymi formami Trochulus hispidus (Gastropoda: Hygromiidae). XXXII Krajowe Seminarium Malakologiczne 13-15 październik 2016 , Spała, Polska. Maltz TK, Kałuski T, Sulikowska-Drozd A (red.) Problemy współczesnej malakologii. Bogucki Wydawnictwo Naukowe, Poznań pp. 57

  29. Proćków M., Kuźnik-Kowalska E., Proćków J., Mackiewicz P. 2016, Ongoing speciation and gene flow between taxonomically challenging Trochulus species complex (Gastropoda: Hygromiidae). World Congress of Malacology - The 19th International Congress of Unitas Malacologica 18-24 July 2016, Penang, Malaysia.

  30. Proćków M., Kuźnik-Kowalska E., Mackiewicz P. 2016, Climate-related shell variation in Trochulus striolatus (Gastropoda: Hygromiidae) and its implications for subspecies taxonomy. World Congress of Malacology - The 19th International Congress of Unitas Malacologica 18-24 July 2016, Penang, Malaysia.

  31. Ratajczak U.Urszula , Shpansky A. V., Malikov D. G., Stefaniak K., Nadachowski A., Ridush B., Wojtal P., Krakhmalnaya T. V., Mackiewicz P. 2016, Quaternary skulls of the saiga from Eastern Europe and Siberia. Saiga borealis versus Saiga tatarica – one species or two? The 3rd Young Natural History Scientists Meeting 2-6 February 2016 , Paris, France. Abstract Book pp. 32-33

  32. Ratajczak U.Urszula , Shpansky A. V., Malikov D. G., Stefaniak K., Nadachowski A., Wojtal P., Ridush B., Krakhmalnaya T. V., Stepanchuk V., Mackiewicz P. 2016, Quateranry skulls of the saiga antelope from Eastern Europe and Siberia: Saiga borealis versus Saiga tatarica – One species or two ? Spotkanie Konsorcjum "Centrum Badań nad Fauną Plejstocenu Europy” (CBFPE), Uniwersytet Wrocławski, Zakład Paleozoologii 18-19 luty 2016, Wrocław, Polska.

  33. Ratajczak U.Urszula , Stefaniak K., Nadachowski A., Mackiewicz P. 2016, Quaternary bone remains of Saiga sp. from Eurasia. The 22nd Quaternary seminar 24-25 November 2016, Brno, Czech Republic. Kana V, Calabkova G, Ivanov M, Brezina J. (eds.) Abstract book pp. 32

  34. Rödiger S., Burdukiewicz M., Schierack P. 2016, R as an Environment for the Reproducible Analysis of DNA European R Users Meeting eRum 2016 12-14 October 2016, Poznań, Polska. Book of Abstracts pp. 65

  35. Schiebel J., Böhm A., Nitschke J., Burdukiewicz M., Weinreich J., Rödiger S., Schierack P. 2016, Investigation of E. coli pathotypes for biofilm formation in association with their phenotypic and genotypic characteristics. 68. Joint Conference of the Society of Hygiene and Microbiology (DGHM) 11-14 September 2016, Ulm, Germany.

  36. Wnętrzak M., Błażej P., Mackiewicz P. 2016, The impact of crossover operator on the genetic code optimization performed by Evolutionary Algorithms. European Conference on Computational Biology ECCB 2016 3-7 September 2016, Hague, Netherlands. Abstracts Data pp. 9

  37. Ziobro J., Błażej P., Mackiewicz P. 2016, Mathematical modelling of immune response. BioInformatics in Toruń – BIT16 16-18 June 2016, Toruń, Polska. Book of Abstracts pp. 61

  38. Ziobro J., Błażej P., Mackiewicz P. 2016, The increase in the antigen concentration European Conference on Computational Biology ECCB 2016 3-7 September 2016, Hague, Netherlands. Abstracts Systems pp. 38

  39. Ziobro J., Błażej P., Mackiewicz P. 2016, The immune system dynamics - computer simulation studies. The 9th Symposium of the Polish Bioinformatics Society 28-30 September 2016, Białystok, Polska.

  40. Ziobro J., Błażej P., Mackiewicz P. 2016, The model of immune system dynamics. German Conference on Bioinformatics GCB 2016 12-15 September 2016, Berlin, Germany. The Guide to GCB 2016 pp. 232

2015

  1. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Mackiewicz P., Kotulska M. 2015, N-gram analysis of amyloid data German Conference on Bioinformatics 2015 27-30 September 2015, Dortmund, Germany. Poster abstracts PeerJ PrePrints pp. 16

  2. Burdukiewicz M., Hugget J., Clement L., Jacobs B., Clement L., Schierack P., Rödiger S. 2015, The dpcR Package – a Framework for Analysis and Visualization of Digital PCR Experiments The 7th International qPCR & NGS Symposium 23-27 March 2015, Freising-Weihenstephan, Germany. Event Proceedings pp. 54-55

  3. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Kotulska M., Mackiewicz P. 2015, biogram: a toolkit for n-gram analysis VII Konwersatorium Chemii Medycznej & VIII Sympozjum Polskiego Towarzystwa Bioinformatycznego 17-19 September 2015, Lublin, Poland. Book of Abstracts: K' pp. 12

  4. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Błażej P., Mackiewicz P. 2015, Predicting eukaryotic signal peptides using hidden Markov models. RECOMB 2015, the 19th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology 12-15 April 2015, Warsaw, Poland. Book of Abstracts pp. 45-46

  5. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Mackiewicz P., Rödiger S. 2015, Methods of Comparing Digital PCR Experiments The 7th International qPCR & NGS Symposium 23-27 March 2015, Freising-Weihenstephan, Germany. Event Proceedings pp. 47-48

  6. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Mackiewicz P., Rödiger S. 2015, dpcReport -- Mobile-Health analysis framework. Potsdam Days on Bioanalysis 1-2 November 2015, Potsdam, Germany.
    [Download]

  7. Gagat P., Bodył A., Mackiewicz P. 2015, Origin of plastids - still a challenge for phylogenetics VII Konwersatorium Chemii Medycznej & VIII Sympozjum Polskiego Towarzystwa Bioinformatycznego 17-19 September 2015, Lublin, Poland.

  8. Gagat P., Bodył A., Mackiewicz P. 2015, Protein trafficking in photosynthetic organelles of the armoured amoeba Paulinella Annual meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution, SMBE 2015 12-16 July 2015, Vienna, Austria. Book of Abstracts pp. 459

  9. Gagat P., Bodył A., Mackiewicz P. 2015, Bioinformatics studies of protein translocons in photosynthetic organelles of the testate amoeba Paulinella chromatophora. RECOMB 2015, the 19th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology 12-15 April 2015, Warsaw, Poland. Book of Abstracts pp. 44

  10. Gagat P., Bodył A., Mackiewicz P. 2015, Model importu białek do fotosyntetycznych organelli Paulinella chromatophora Technologie informatyczne dla badań i rozwoju. 20 lat Wrocławskiego Centrum Sieciowo-Superkomputerowego 25 czerwiec 2015 , Wrocław, Polska.

  11. Grabińska M., Błażej P., Mackiewicz P. 2015, Application of Monte Carlo simulations and Metropolis-Hastings algorithm in analysis of mutation accumulation in three codon positions of protein coding sequences. RECOMB 2015, the 19th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology 12-15 April 2015, Warsaw, Poland. Book of Abstracts pp. 48

  12. Kroczak A., Urantówka A. D., Mackiewicz P. 2015, Influence of methods and molecular markers’ selection on inferring phylogenetic relationships in the example of parrots from tribe Arini. RECOMB 2015, the 19th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology 12-15 April 2015, Warsaw, Poland. Book of Abstracts pp. 51

  13. Kroczak A., Urantówka A. D., Mackiewicz P. 2015, Phylogenetic relationships within tribe Arini (parrots, Psittaciformes) based on various methods and molecular markers VII Konwersatorium Chemii Medycznej & VIII Sympozjum Polskiego Towarzystwa Bioinformatycznego 17-19 September 2015, Lublin, Poland.

  14. Mackiewicz D., Cebrat S. 2015, Non-random distribution of recombination hotspot motifs in human genome. RECOMB 2015, the 19th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology 12-15 April 2015, Warsaw, Poland. Book of Abstracts pp. 65-66

  15. Mackiewicz D. 2015, Gene evolution in dependence on position on human chromosomes Annual meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution, SMBE 2015 12-16 July 2015, Vienna, Austria. Book of Abstracts pp. 50

  16. Mackiewicz P. 2015, Narzędzia bioinformatyczne w genotypowaniu mikroorganizmów Konferencja – Platforma MultiGenBank, Instytut Immunologii i Terapii Doświadczalnej PAN we Wrocławiu 14 grudnia 2015, Wrocław, Polska.

  17. Nadachowski A., Baca M., Lipecki G., Mackiewicz P., Marciszak A., Popović D., Socha P., Stefaniak K., Wojtal P. 2015, Wpływ zmian klimatycznych w póznym plejstocenie na migracje ssaków w srodkowej Europie. 2. Konferencja Naukowa Zmiany klimatyczne w przeszłości geologicznej, Państwowy Instytut Geologiczny, Państwowy Instytut Badawczy 24-25 listopad 2015, Warszawa, Polska. Tom abstraktów konferencyjnych, referaty i postery pp. 64-65

  18. Nadachowski A., Popović D., Baca M., Stefaniak K., Lipecki G., Marciszak A., Sabol M., Ridush B., Roblíčková M., Káňa V., Obada T., Stankovic A., Mackiewicz P. 2015, Phylogeography of cave bear from Central and Eastern Europe in the light of ancient DNA studies 7th European Congress of Mammalogy 17-21 August 2015, Stockholm, Sweden. Abstracts pp. 107

  19. Pawlik K., Kotowska M., Korzeniowska-Kowal A., Mackiewicz P. 2015, SynKeD – Synthetic polyKetide Designer, a synthetic biology tool for computer aided designing of new polyketide products The 6th International Weigl Conference on Microbiology 8–10 July 2015, Gdańsk, Poland. Acta Biochimica Polonica, Supplement 2, 2015, Abstracts pp. 79

  20. Pawlik K., Mackiewicz P., Tobiasz A., Kozub K., Korzeniowska-Kowal A. 2015, A microbiological module of MultiGenBank database The 6th International Weigl Conference on Microbiology 8–10 July 2015, Gdańsk, Poland. Acta Biochimica Polonica, Supplement 2, 2015, Abstracts pp. 80

  21. Popović D., Baca M., Stefaniak K., Lipecki G., Nadachowski A., Marciszak A., Sabol M., Ridush B., Roblíčková M., Káňa V., Obada T., Stankovic A., Mackiewicz P. 2015, Genetic diversity and evolution of cave bear from Central and Eastern Europe Annual meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution, SMBE 2015 12-16 July 2015, Vienna, Austria. Book of Abstracts pp. 1046

  22. Popović D., Baca M., Stefaniak K., Lipecki G., Nadachowski A., Marciszak A., Sabol M., Ridush B., Roblíčková M., Káňa V., Obada T., Stankovic A., Mackiewicz P. 2015, Genetic studies of cave bear (Ursus ingressus) populations from Central and Eastern Europe. Polish Evolutionary Conference 24-26 September 2015, Poznań, Polska. Program & Abstracts pp. 68-69

  23. Popović D., Baca M., Stefaniak K., Lipecki G., Nadachowski A., Marciszak A., Sabol M., Ridush B., Roblíčková M., Káňa V., Obada T., Stankovic A., Mackiewicz P. 2015, Genetic studies of cave bear (Ursus ingressus) populations from Central and Eastern Europe The 21th International Cave Bear Symposium (ICBS), The Netherlands, 2015 10-13 September 2015, Hellevoetsluis, Netherlands. Program & Abstracts pp. 28

  24. Posacki P., Mackiewicz P. 2015, Monte Carlo simulations of mammalian sex chromosomes evolution. RECOMB 2015, the 19th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology 12-15 April 2015, Warsaw, Poland. Book of Abstracts pp. 47

  25. Proćków M., Strzała T., Kuźnik-Kowalska E., Proćków J., Mackiewicz P. 2015, Wielometodyczne podejście do identyfikacji Gatunków z rodzaju Trochulus (Gastropoda: Hygromiidae) XXXI Krajowe Seminarium Malakologiczne 22-25 wrzesień 2015, Wieliczka, Polska. Problemy współczesnej malakologii - Streszczenia pp. 38-39

  26. Rödiger S., Burdukiewicz M., Spiess A., Blagodatskikh K., Schierack P. 2015, RKWard: a Software Framework for Analysis of qPCR, dPCR, qIA and Melting Curve Data The 7th International qPCR & NGS Symposium 23-27 March 2015, Freising-Weihenstephan, Germany. Event Proceedings pp. 55

  27. Rödiger S., Burdukiewicz M. 2015, Reproducible Analysis of DNA Amplification Experiments with an Open Source Software Environment The 67. Joint Conference of the Society of Hygiene and Microbiology (DGHM) 27-30 September 2015, Münster, Germany.

  28. Rödiger S., Burdukiewicz M., Spiess A. 2015, Impact of Smoothing on Parameter Estimation in Quantitative DNA Amplification Experiments The 7th International qPCR & NGS Symposium 23-27 March 2015, Freising-Weihenstephan, Germany. Event Proceedings pp. 31-32

  29. Sobczyk P., Burdukiewicz M., Lauber C., Mackiewicz P. 2015, Quick Permutation Test: feature filtering of n-gram data. RECOMB 2015, the 19th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology 12-15 April 2015, Warsaw, Poland. Book of Abstracts pp. 46-47

  30. Weigel C., Mackiewicz P. 2015, An extended set of oriC predictions for the Cyanobacteria DNA replication, chromosome segregation and cell division, EMBO Conference 27–31 July 2015, Egham, United Kingdom.

  31. Wnętrzak M., Błażej P., Mackiewicz P. 2015, Genetic code optimality as a multiobjective optimization problem VII Konwersatorium Chemii Medycznej & VIII Sympozjum Polskiego Towarzystwa Bioinformatycznego 17-19 September 2015, Lublin, Poland. Book of Abstracts: P pp. 20

  32. Wnętrzak M., Błażej P., Mackiewicz P. 2015, Assessing the genetic code optimality using multiobjective optimization approach German Conference on Bioinformatics 2015 27-30 September 2015, Dortmund, Germany. Poster abstracts PeerJ PrePrints pp. 26

  33. Wnętrzak M., Błażej P., Mackiewicz P. 2015, Optimality of the canonical genetic code under multiobjective and mutually exclusive criteria. RECOMB 2015, the 19th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology 12-15 April 2015, Warsaw, Poland. Book of Abstracts pp. 50-51

2014

  1. Błażej P., Mackiewicz P., Grabińska M. 2014, Multiobjective optimization of mutation accumulation in bacterial genomes. BIO 2014 Congress, 1st Congress of the Polish Biochemistry, Cell Biology, Biophysics and Bioinformatics 9-12 September 2014, Warsaw, Poland. Acta Biochimica Polonica, 61, supplement 1, Abstracts pp. 78

  2. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Błażej P., Mackiewicz P. 2014, Signal peptide prediction using hidden Markov models. BIO 2014 Congress, 1st Congress of the Polish Biochemistry, Cell Biology, Biophysics and Bioinformatics 9-12 September 2014, Warsaw, Poland. Acta Biochimica Polonica, 61, supplement 1, Abstracts pp. 74

  3. Burdukiewicz M., Kolenda R., Schierack P. 2014, Prevalence of Shiga toxin-producing, enterohemorrhagic and enteropathogenic Escherichia coli – a systematic review The 4. Joint Conference of the Association for General and Applied Microbiology (VAAM) and the Society of Hygiene and Microbiology (DGHM) 5-8 October 2014, Dresden, Germany.

  4. Gagat P., Bodył A., Mackiewicz P. 2014, Evolution of protein transport systems in primary plastids and Paulinella chromatophores. Plant Molecular Cytogenetics in Genomic and Postgenomic Era 23-24 September 2014, Katowice, Poland. Abstract Book pp. 43

  5. Grabińska M., Błażej P., Mackiewicz P. 2014, Searching for mutational matrices in bacterial genomes. BIO 2014 Congress, 1st Congress of the Polish Biochemistry, Cell Biology, Biophysics and Bioinformatics 9-12 September 2014, Warsaw, Poland. Acta Biochimica Polonica, 61, supplement 1, Abstracts pp. 84

  6. Grabińska M., Błażej P., Mackiewicz P. 2014, Studies of Mutation Accumulation in Three Codon Positions using Monte Carlo Simulations and Metropolis-Hastings Algorithm. BIOSTEC 2014, 7th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies, Bioinformatics 2014, 5th International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms 3-6 March 2014, Angers, Loire Valley, France. Final Program and Book of Abstracts, pp.86, Proceedings, Papers pp. 245-252

  7. Kolenda R., Burdukiewicz M., Rödiger S., Schierack P. 2014, Prevalence of F5 fimbriae in Escherichia coli isolated from diarrheic and healthy calves since 1976 – a meta-analytical approach The 4. Joint Conference of the Association for General and Applied Microbiology (VAAM) and the Society of Hygiene and Microbiology (DGHM) 5-8 October 2014, Dresden, Germany.

  8. Mackiewicz P. 2014, Mono- czy poligeneza? Pramatka i praojciec. Jaki początek? Wiara i rozum o początku człowieka. Inicjatywa Akademicka Fides et ratio, Towarzystwo Studiów Interdyscyplinarnych przy Papieskim Wydziale Teologicznym we Wrocławiu 26 marzec.2014, Wrocław, Polska.

  9. Mackiewicz P., Baca M., Popović D., Stankovic A., Stefaniak K., Socha P., Marciszak A., Węgleński P., Nadachowski A. 2014, Znaczenie analiz kopalnego DNA. 48. Sympozjum Speleologiczne 16-19 październik 2014, Kletno, Polska. Materiały pp. 91-92

  10. Mackiewicz P. 2014, Software used in phylogenetic analyses Bioinformatyka – rozwój oferty edukacyjnej Uniwersytetu Przyrodniczego we Wrocławiu 24 January 2014, Wrocław, Poland.

  11. Mackiewicz P., Wiszniowska T., Stefaniak K., Socha P., Nadachowski A. 2014, Wnioskowanie o diecie niedźwiedzia jaskiniowego w oparciu o analizę grubości i struktury szkliwa zębów. 48. Sympozjum Speleologiczne 16-19 październik 2014, Kletno, Polska. Materiały pp. 89-90

  12. Popović D., Baca M., Stefaniak K., Lipecki G., Nadachowski A., Sabol M., Ridush B., Roblíčková M., Káňa V., Stankovic A., Mackiewicz P. 2014, Badania genetyczne populacji niedźwiedzia jaskiniowego (Ursus spelaeus) z Europy Środkowej i Wschodniej. 48. Sympozjum Speleologiczne 16-19 październik 2014, Kletno, Polska. Materiały pp. 105-106

  13. Rödiger S., Burdukiewicz M., Spiess A., Blagodatskikh K., Schierack P. 2014, Statistical methods of comparing digital PCR experiments qPCR & Digital PCR Congress 20-21 October 2014, London, United Kingdom.

2013

  1. Augustyniak D., Bonarowska J., Mackiewicz P., Drulis-Kawa Z. 2013, Antibodies against outer membrane proteins of Moraxella catarrhalis and nontypeable Haemophilus influenza cross-react with various pathogens of human respiratory tract. 15th International Congress of Immunology (ICI) 22-27 August 2013 , Milan, Italy. Front. Immunol. Conference Abstract: doi: 10.3389/conf.fimmu.2013.02.00907

  2. Bielecki M., Mackiewicz P., Śmiga M., Olczak M., Gmiterek A., Olczak T. 2013, Characterization of Porphyromonas gingivalis hmuy homologs from Prevotella intermedia. 5th Congress of European Microbiologists, FEMS 2013 21-25 July 2013, Leipzig, Germany.

  3. Błażej P., Mackiewicz P., Grabińska M., Cebrat S. 2013, Computer simulation of prokaryotic genomes evolution under two mutational pressures. The 13th Annual International Conference Bioinformatics 2013 of the Society for Bioinformatics in Northern Europe and Polish Bioinformatics Society, SocBiN/BIT13 26-29 June 2013, Toruń, Poland. Book of Abstracts pp. 55

  4. Błażej P., Mackiewicz P., Cebrat S., Grabińska M. 2013, Is the process of mutation introduction optimized in biological systems? 11th Workshop on Bioinformatics and 6th Symposium of the Polish Bioinformatics 27–29 September 2013, Wrocław, Poland. Abstract Book pp. 11

  5. Błażej P., Mackiewicz P., Cebrat S., Grabińska M. 2013, On the optimal process of nucleotide substitution. German-Polish Joint Conference on Probability and Mathematical Statistics 6-9 June 2013, Toruń, Poland. Book of Abstracts and Complete Programme pp. 100-101

  6. Błażej P., Mackiewicz P., Cebrat S., Wańczyk M. 2013, Using Evolutionary Algorithms in Finding of Optimized Nucleotide Substitution Matrices. The Genetic and Evolutionary Computation Conference, GECCO'13 6–10 July 2013, Amsterdam, The Netherlands. Conference Program pp. 138; Proceedings, Companion ACM: pp. 41-42

  7. Błażej P., Mackiewicz P., Wańczyk M., Cebrat S. 2013, Evolution of Bacterial Genome under Changing Mutational Pressure Computer Simulation Studies. BIOSTEC 2013, 6th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies, Bioinformatics 2013, 4th International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms 11-14 February 2013, Barcelona, Spain. Final Program and Book of Abstracts pp. 33, Proceedings, Papers pp. 272-277

  8. Burdukiewicz M., Spiess A., Schierack P., Rödiger S. 2013, dpcR: an R package for the analysis of digital PCR qPCR & Digital PCR Congress 9-10 September 2013, Lyon, France.

  9. Cebrat S. 2013, Genetyczne konsekwencje zapłodnienia pozaustrojowego Poznaj prawdę o in vitro 23 March 2013, Legnica, Polska.

  10. Cebrat S. 2013, Szanse i zagrożenia leczenia niepłodności okiem genetyka NaProTECHNOLOGY W DIAGNOZOWANIU I LECZENIU NIEPŁODNOŚCI. Szanse, wyzwania efekty. 9 March 2013, Góra św. Anny, Polska.

  11. Cebrat S. 2013, Sympatric speciation and chromosome evolution in the computer simulations. 11th Workshop on Bioinformatics and 6th Symposium of the Polish Bioinformatics 27–29 September 2013, Wrocław, Poland. Abstract Book pp. 4

  12. Gagat P., Bodył A., Mackiewicz P. 2013, The role of vesicular trafficking in evolution of primary plastids inferred from bioinformatics analyses 11th Workshop on Bioinformatics and 6th Symposium of the Polish Bioinformatics 27–29 September 2013, Wrocław, Poland. Abstract Book pp. 24

  13. Gagat P., Mackiewicz P., Bodył A. 2013, Model for protein import into the photosynthetic organelles of Paulinella chromatophora inferred from bioinformatics analyses. The 13th Annual International Conference Bioinformatics 2013 of the Society for Bioinformatics in Northern Europe and Polish Bioinformatics Society, SocBiN/BIT13 26-29 June 2013, Toruń, Poland. Book of Abstracts pp. 64

  14. Grabińska M., Błażej P., Mackiewicz P., Cebrat S. 2013, Comparison of bacterial genome evolution under real and artificial mutational pressures. The 13th Annual International Conference Bioinformatics 2013 of the Society for Bioinformatics in Northern Europe and Polish Bioinformatics Society, SocBiN/BIT13 26-29 June 2013, Toruń, Poland. Book of Abstracts pp. 68

  15. Grabińska M., Błażej P., Mackiewicz P. 2013, Evolution of protein coding sequences in two bacterial genomes under mutational pressure associated with replication. 11th Workshop on Bioinformatics and 6th Symposium of the Polish Bioinformatics 27–29 September 2013, Wrocław, Poland. Abstract Book pp. 30

  16. Mackiewicz P., Moszczyński K., Bodył A. 2013, Structural and comparative analysis of the peculiar plastid genome from peridinin dinoflagellate algae. The 13th Annual International Conference Bioinformatics 2013 of the Society for Bioinformatics in Northern Europe and Polish Bioinformatics Society, SocBiN/BIT13 26-29 June 2013, Toruń, Poland. Book of Abstracts pp. 90

  17. Mackiewicz D., de Oliveira P. M., de Oliveira S. M., Cebrat S. 2013, The role of purifying selection in hotspot distributions along human chromosomes. The 13th Annual International Conference Bioinformatics 2013 of the Society for Bioinformatics in Northern Europe and Polish Bioinformatics Society, SocBiN/BIT13 26-29 June 2013, Toruń, Poland. Book of Abstracts pp. 91

  18. Posacki P., Cebrat S. 2013, Simulations of evolution of populations with changing mutation rate. 11th Workshop on Bioinformatics and 6th Symposium of the Polish Bioinformatics 27–29 September 2013, Wrocław, Poland. Abstract Book pp. 57

  19. Rödiger S., Lehmann W., Frömmel U., Böhm A., Nitschke J., Burdukiewicz M., Schröder C., Dangla R., Droniou M., Schierack P. 2013, The Modi Operandi of the VideoScan Platform for the Detection and Analysis of Nucleic Acids Life Science Day 2013, 17. Leibniz Conference of Advanced Science 24 October 2013, Berlin, Germany. Abstract Book pp. 21

  20. Sobczyński M., Mackiewicz P. 2013, Application of self-organizing maps and evolutionary algorithm in studies of amino acid composition of proteins in microorganisms grouped according to different environmental features. 11th Workshop on Bioinformatics and 6th Symposium of the Polish Bioinformatics 27–29 September 2013, Wrocław, Poland. Abstract Book pp. 58

  21. Sobczyński M., Mackiewicz P. 2013, Analysis of Relationship Between Amino Acid Composition of Proteins and Environmental Features of Microorganisms Using Evolutionary Algorithm and Self-Organizing Maps. The Genetic and Evolutionary Computation Conference, GECCO'13 6–10 July 2013, Amsterdam, The Netherlands. Conference Program pp. 138; Proceedings, Companion ACM: pp. 45-46

  22. Wójcik E. A., Brzostek A., Bacolla A., Mackiewicz P., Vasquez K. M., Korycka-Machala M., Jaworski A., Dziadek J. 2013, Naprawa podwójnych pęknięć DNA a niestabilności generowane obecnością prostych i odwróconych powtórzeń u Mycobacterium. IV Polski Kongres Genetyki 10-13 września 2013, Poznań, Polska.

2012

  1. Baca M., Stankovic A., Popović D., Stefaniak K., Marciszak A., Hofreiter M., Nadachowski A., Węgleński P., Mackiewicz P. 2012, Genetic and biometric analysis of cave bear specimens from Niedźwiedzia Cave (Sudetes, Poland). The 18th International Cave Bear Symposium (ICBS) and the International Workshop “Fossil remains in karst and their role in reconstructing Quaternary paleoclimate and paleoenvironment” 20-22 September 2012, Băile Herculane, Romania. Program, abstracts, field trip guide Constantin Silviu (ed.), Băile Herculane-Romania: "Emil Racovita" Institute of Speleology, 2012 pp. 15

  2. Błażej P., Mackiewicz P., Wańczyk M. 2012, Sztuczna presja mutacyjna XXXVIII Konferencja Statystka Matematyczna 3-7.12.2012, Wisła, Polska. Streszczenia referatów pp. 12

  3. Błażej P., Mackiewicz P., Cebrat S. 2012, Simulation of bacterial genome evolution under replicational mutational pressures. BIOSTEC 2012, 5th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies, Bioinformatics 2012, International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms 1-4 February 2012, Algarve, Portugal. Final Program and Book of Abstracts pp. 93-94; Proceedings, Papers pp. 51-57

  4. Bonarowska J., Mackiewicz P., Augustyniak D. 2012, Analiza in silico podobieństwa między białkami błony zewnętrznej Moraxella catarrhalis a białkami powierzchniowymi innych patogenów układu oddechowego człowieka II Ogólnopolska Konferencja Naukowo-Szkoleniowa "Wektory i patogeny w przeszłości i przyszłości" 23 listopad 2012, Wrocław, Polska.

  5. Cebrat S. 2012, Prediction of functional structure of eukaryotic chromosomes in computer modeling Polish-German Biochemical Societies Joint Meeting 11-14 September 2012, Poznań, Polska. Acta Biochimica Polonica pp. 19

  6. Cebrat S. 2012, Genetyka - nauka, stawiająca człowieka przed problemami, przed jakimi nigdy w swojej historii nie stawał. Jubileuszowe X Forum Nauczycieli Przedmiotów Przyrodniczych „Od pytania do działania, czyli jak wspólnie z uczniem odkrywać tajemnice przyrody”. 24 listopada 2012, Kraków, Polska.

  7. Cebrat S. 2012, Jak zmienia się genom rodziców i jakie niesie to konsekwencje dla kolejnych pokoleń. Konferencja NaProTECHNOLOGYTM W DIAGNOZOWANIU I LECZENIU NIEPŁODNOŚCI. Szanse, wyzwania efekty. 24 marca 2012, Wrocław, Polska.

  8. Gagat P., Mackiewicz P., Bodył A. 2012, Protein import into the cyanobacterial endosymbionts/plastids of Paulinella chromatophora. 7th International Symbiosis Society Congress “The earth’s vast symbiosphere” 22-28 July 2012, Kraków, Poland. Book of Abstracts pp. 44

  9. Gagat P., Mackiewicz P., Bodył A. 2012, How protein targeting to primary plastids via the endomembrane system could have evolved? Society for Molecular Biology & Evolution, SMBE 2012 23-26 June 2012, Dublin, Ireland. Conference abstracts pp. 395

  10. Gagat P., Mackiewicz P., Bodył A. 2012, Protein import into Paulinella photosynthetic organelles. Conference of the Czech Phycological Society 10-13 September 2012, Ostrava, Czech Republic.

  11. Mackiewicz D., de Oliveira P. M., de Oliveira S. M., Cebrat S. 2012, Analyses and computer simulations of hotspot distributions in human genome. Society for Molecular Biology & Evolution, SMBE 2012 23-26 June 2012, Dublin, Ireland. Conference abstracts pp. 831

  12. Mackiewicz P., Moszczyński K., Bodył A. 2012, Horizontal gene transfer from bacteroidetes bacteria to dinoflagellate minicircles. 7th International Symbiosis Society Congress “The earth’s vast symbiosphere” 22-28 July 2012, Kraków, Poland. Book of Abstracts pp. 125

  13. Mackiewicz P., Baca M., Stankovic A., Stefaniak K., Marciszak A., Hofreiter M., Nadachowski A., Węgleński P. 2012, Phylogenetic analysis of cave bear specimens from Niedzwiedzia Cave, Sudetes, Poland. Society for Molecular Biology & Evolution, SMBE 2012 23-26 June 2012, Dublin, Ireland. Conference abstracts pp. 278

  14. Mackiewicz P., Szpak M., Stankovic A. 2012, Analizy filogenetyczne sekwencji z genomu mitochondrialnego rosomaka (Gulo gulo). Spotkanie Konsorcjum "Centrum Badań nad Fauną Plejstocenu Europy” (CBFPE), Uniwersytet Wrocławski, Zakład Paleozoologii, Wrocław 6-7 listopad 2012, Wrocław, Polska.

  15. Proćków M., Pieńkowska J., Mackiewicz P. 2012, Analiza morfologiczna i filogenetyczna Trochulus phorochaetius (Bourguignat, 1864) i pokrewnych taksonów. XXVIII Krajowe Seminarium Malakologiczne 8-11 maja 2012, Boszkowo k/Leszna, Polska. Problemy współczesnej malakologii 2012 pp. 39-40

  16. Waga W., Cebrat S. 2012, Monte-Carlo model of the human genome evolution COST Action MP0801: Physics of Competition and Conflict Annual Meeting 2012 11-13 July 2012, Galway, Ireland.

  17. Wańczyk M., Błażej P., Mackiewicz P., Cebrat S. 2012, How to deal with small Open Reading Frames? BIOSTEC 2012, 5th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies, Bioinformatics 2012, International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms 1-4 February 2012, Algarve, Portugal. Final Program and Book of Abstracts pp. 94-95; Proceedings, Papers pp. 246-250

  18. Wańczyk M., Błażej P., Mackiewicz P. 2012, Influence of mutational pressure on protein coding sequences in bacterial genomes. Eighteenth National Conference on Applications of Mathematics in Biology and Medicine. 23-27 September 2012, Krynica Morska, Polska. Proceedings of the Eighteenth National Conference on Applications of Mathematics in Biology and Medicine pp. 136-141

  19. Wańczyk M., Błażej P., Mackiewicz P. 2012, Comparison of two algorithms based on Markov processes for recognizing protein coding sequences in prokaryotic genomes. 10th Workshop on Bioinformatics and 5th Symposium of the Polish Bioinformatics Society 25 – 27 May 2012, Gdańsk, Poland. Book of Abstracts pp. 86

2011

  1. Błażej P., Mackiewicz P., Cebrat S. 2011, Algorithm for finding coding signal using homogeneous Markov chains independently for three codon positions 2011 International Conference on Bioinformatics and Computational Biology (ICBCB 2011) 22-24 February 2011, Haikou, China. Proceedings pp. 20-24
    [Download]

  2. Błażej P., Mackiewicz P., Cebrat S. 2011, Modeling of prokaryotic genome evolution using coding signal as selection pressure The 8-th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, and Annual Meeting of the Society for Mathematical Biology June 28 - July 2, 2011, Kraków, Polska. Book of Abstracts pp. 103

  3. Błażej P., Mackiewicz P., Cebrat S. 2011, Simulation of prokaryotic gene evolution under coding signal as selection pressure. European Conference on Complex Systems, ECCS'11 Vienna 12-16 September 2011, Vienna, Austria. Book of Abstracts pp. 20

  4. Cebrat S. 2011, Genetyczny początek i genetyczny porządek życia ludzkiego Profilaktyka zdrowia prokreacyjnego - Wokół początków ludzkiego życia 15.10.2011, Warszawa, Polska.

  5. Gagat P., Mackiewicz P., Bodył A. 2011, Evolution of the endomembrane system-mediated protein targeting to the plastids with two envelope membranes Comparative Genomics of Eukaryotic Microorganisms: Understanding the Complexity of Diversity 15-20 October 2011, San Feliu de Guixols, Spain.

  6. Gagat P., Mackiewicz P., Bodył A. 2011, Evolution of protein targeting via endomembrane system to primary plastids The 8-th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, and Annual Meeting of the Society for Mathematical Biology June 28 - July 2, 2011, Kraków, Polska. Book of Abstracts pp. 326

  7. Mackiewicz D., de Oliveira P. M., de Oliveira S. M., Cebrat S. 2011, Distribution of recombination hotspots in human genome - the comparison of computer simulations and real data The 8-th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, and Annual Meeting of the Society for Mathematical Biology June 28 - July 2, 2011, Kraków, Polska. Book of Abstracts pp. 606-607

  8. Mackiewicz P., Bodył A., Gagat P. 2011, How nuclear-encoded proteins are imported into the cyanobacterial endosymbionts/plastids of Paulinella chromatophora? Comparative Genomics of Eukaryotic Microorganisms: Understanding the Complexity of Diversity 15-20 October 2011, San Feliu de Guixols, Spain. EMBO Conference Series pp. 120

  9. Mackiewicz P., Drulis-Kawa Z., Maciaszczyk-Dziubińska E., Kropinski A. M. 2011, Clustering and genomic analysis of phages from Podoviridae family The 8-th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, and Annual Meeting of the Society for Mathematical Biology June 28 - July 2, 2011, Kraków, Polska. Book of Abstracts pp. 608

  10. Sergiel A., Maślak R., Sobczyński M. 2011, Stereotypic behaviour patterns and other stress indicators in captive bears. The 20th International Conference on Bear Research & Management 17-23 July, Ottawa, Canada. Proceedings of the 20th International Conference on Bear Research & Management pp. 187

  11. Sobczyński M., Mackiewicz P. 2011, Application of self-organizing maps to description of relationship between amino acid composition of proteins and ecological properties of microorganisms. The Seventeenth National Conference on Applications of Mathematics in Biology and Medicine. 1-6 September 2011, Zakopane-Kościelisko, Poland. Proceedings of the Seventeenth National Conference on Applications of Mathematics in Biology and Medicine. pp. 96-101

  12. Waga W., Cebrat S. 2011, Modelling the Evolution of Spatial Distributed Populations in a Uniformly Changing Environment - Sympatric Speciation. European Conference on Complex Systems, ECCS'11 Vienna 12-16 September 2011, Vienna, Austria. Book of Abstracts pp. 133

  13. Waga W., Cebrat S. 2011, Sympatric speciation in the changing environment - Monte Carlo simulations The 8-th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, and Annual Meeting of the Society for Mathematical Biology June 28 - July 2, 2011, Kraków, Polska.

  14. Wańczyk M., Błażej P., Mackiewicz P. 2011, Comparison of two algorithms based on Markov chains applied in recognition of protein coding sequences in prokaryotes. The Seventeenth National Conference on Applications of Mathematics in Biology and Medicine. 1-6 September 2011, Zakopane-Kościelisko, Poland. Proceedings of the Seventeenth National Conference on Applications of Mathematics in Biology and Medicine. pp. 118-123

2010

  1. Błażej P. 2010, Robust estimation of the scale parameter and weighted distributions. International Conference on Robust Statistic 28 June - 2 July 2010, Prague, Czech Republic. Book of Abstracts pp. 14

  2. Błażej P., Mackiewicz P., Cebrat S. 2010, Using the genetic code wisdom for recognizing protein coding sequences. The 2010 International Conference on Bioinformatics & Computational Biology, BIOCOMP 2010 12-15 July 2010, Las Vegas Nevada, USA. Proceedings of the 2010 International Conference on Bioinformatics & Computational Biology, Vol. I pp. 302-305
    [Download]

  3. Błażej P., Mackiewicz P., Cebrat S. 2010, Nowe podejście do identyfikowania sekwencji kodujących białko w genomach prokariotycznych wykorzystujące modele Markowa III Polski Kongres Genetyki 12-15 września 2010, Lublin, Polska. Streszczenia pp. 233

  4. Bodył A., Mackiewicz P., Gagat P. 2010, Did trypanosomatid parasites contain a plastid in their evolutionary past? 14th Evolutionary Biology Meeting at Marseilles 21-24 September 2010, Marseilles, France. Book of Abstracts: Poster 30

  5. Cebrat S., Waga W., Biecek P. 2010, Modelling evolution of Y chromosome, altruism and sexual antagonism or from biological to social conflicts Annual Meeting of COST Action MP0801:Physics of Competitions and Conflicts 27 May, Sofia Sunny Beach, Bulgaria.

  6. Cebrat S. 2010, Co to znaczy "losowy" w teorii ewolucji? III Polski Kongres Genetyki 12-15 września 2010, Lublin, Polska. Streszczenia pp. 204

  7. Gagat P., Mackiewicz P., Bodył A. 2010, W jaki sposób wyewoluował wewnątrzbłonowy szlak importu białek do plastydów pierwotnych? III Polski Kongres Genetyki 12-15 września 2010, Lublin, Polska. Streszczenia pp. 208

  8. Gagat P., Mackiewicz P., Bodył A. 2010, How endomembrane-system mediated protein targeting into primary plastids could have evolved? 14th Evolutionary Biology Meeting at Marseilles 21-24 September 2010, Marseilles, France. Book of Abstracts: PP9

  9. Kowalski J., Cebrat S. 2010, Evolution of the recombination rate distribution along chromosome in Penna model. XVI Krajowa Konferencja Zastosowań Matematyki w Biologii i Medycynie 14-18 września 2010, Krynica, Polska. Proceedings of the Sixteen National Conference on Applications of Mathematics in Bology and Medicine pp. 71-75

  10. Mackiewicz P., Moszczyński K., Bodył A. 2010, Pochodzenie bakteryjne niektórych minichromosomów u bruzdnic Ceratium horridum i Pyrocystis lunula III Polski Kongres Genetyki 12-15 września 2010, Lublin, Polska. Streszczenia pp. 209

  11. Mackiewicz P., Bodył A. 2010, W jaki sposób białka kodowane przez jądro gospodarza są transportowane do endosymbiontów cyjanobakteryjnych u Paulinella chromatophora? III Polski Kongres Genetyki 12-15 września 2010, Lublin, Polska. Streszczenia pp. 259

  12. Mackiewicz D., Waga W., Zawierta M., Cebrat S. 2010, Rekombinacja a ewolucja chromosomów eukariotycznych III Polski Kongres Genetyki 12-15 września 2010, Lublin, Polska. Streszczenia pp. 57

  13. Mackiewicz D., Waga W., Zawierta M., Cebrat S. 2010, Strategies of eukaryotic chromosome evolution - comparing the real human and virtual, computer simulated genomes. The 18th Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution, SMBE 2010 4-8 July 2010, Lyon, France. Conference program pp. 33

  14. Mackiewicz P., Wyroba E. 2010, Duplication events in evolution of Rab7 and Rab9 proteins. The 18th Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution, SMBE 2010 4-8 July 2010, Lyon, France. Conference program pp. 32
    [Download]

  15. Sergiel A., Sobczyński M. 2010, Monitoring stress in captive bears using non-invasive fecal enzyme immuno-assay (EIA) The 19th International Conference on Bear Research and Management 16-22 May 2010, Tbilisi, Georgia.

  16. Sergiel A., Sobczyński M. 2010, Monitoring stress in captive bears using non-invasive fecal enzyme immuno-assay (EIA). Sesja naukowa Polskiego Towarzystwa Etologicznego 16 października, Warszawa, Polska. The book of abstracts pp. 22

  17. Sochocka M., Zaczyńska E., Sobczyński M., Czarny A., Taboł A., Leszek J., Błach-Olszewska Z. 2010, Influence of donepezil and Ginkgo Biloba extract (EGB 761) on innate antiviral immunity of human leukocytes The 4th European Congress of Virology 7-11 April 2010, Cernobbio, Lake Como, Italy.

  18. Strzała T., Kosowska B., Mackiewicz P., Pilot M., Moska M., Marszałek-Kruk B., Stamatis C., Mamuris Z. 2010, Charakterystyka genetyczna polskiej populacji zająca szaraka Lepus europaeus na podstawie mitochondrialnego DNA III Polski Kongres Genetyki 12-15 wrzesień 2010, Lublin, Polska. Streszczenia pp. 168

  19. Waga W., Cebrat S. 2010, Computer modelling of biological conflicts in the human reproduction Annual Meeting of COST Action MP0801:Physics of Competitions and Conflicts 27 May, Sofia, Sunny Beach, Bulgaria.

  20. Waga W., Mackiewicz D., Cebrat S. 2010, Genome evolution in the computer models of sympatric speciation in the spatially distributed populations The 18th Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution, SMBE 2010 4-8 July 2010, Lyon, France. Conference program pp. 35
    [Download]

  21. Wójcik E. A., Brzostek A., Bacolla A., Mackiewicz P., Dziadek J. 2010, Niezwykłe struktury DNA a niestabilność genomu mykobakterii III Polski Kongres Genetyki 12-15 września 2010, Lublin, Polska. Streszczenia pp. 240

  22. Wójcik E. A., Brzostek A., Bacolla A., Mackiewicz P., Dziadek J. 2010, Unusual DNA structures and instabilities in mycobacterial genome Warsztaty Mikrobiot 2010, II Ogólnopolskie Warsztaty Mikrobiologia w Ochronie Zdrowia i Srodowiska 9-10 wrzesień 2010, Łódz, Polska.

  23. Zwolińska K., Piasecki E., Sobczyński M., Knysz B., Gąsiorowski J., Gładysz A. 2010, KIR3DL1/L1 and KIR3DL1/S1 genotypes against HIV-1 infection. The 4th European Congress of Virology 7-11 April 2010, Cernobbio, Lake Como, Italy.

2009

  1. Błażej P. 2009, Robust estimation of the scale parameter in weighted models. The Pyrenees International Workshop on Statistics Probability and Operations Research. 15-18 September 2009, Jaca, Spain. Book of Abstracts pp. 37

  2. Bodył A., Mackiewicz P. 2009, Do cyanobacterial endosymbionts of the amoeba Paulinella chromatophora possess an import apparatus for nuclear-encoded proteins? A hypothesis based on analysis of their complete genome and other cyanobacterial genomes Workshop on Molecular Systematics of Amoebozoa and Rhizaria 12-13 January 2009, Geneva, Switzerland.

  3. Bodył A., Mackiewicz P., Stiller J. W., Gagat P. 2009, How are nuclear-encoded proteins imported into the cyanobacterial endosymbionts of Paulinella chromatophora Leopoldina-Symposium, Molecular Genetics of Chloroplasts and Mitochondria 20-23 September 2009, Berlin, Germany. Book of Abstracts pp. 48

  4. Bodył A., Mackiewicz P., Gagat P. 2009, Pre-sequences of class c iron-containing superoxide dismutases provide evidence for the former existence of a plastid in trypanosomatid parasites Leopoldina-Symposium, Molecular Genetics of Chloroplasts and Mitochondria 20-23 September 2009, Berlin, Germany. Book of Abstracts pp. 47

  5. Cebrat S. 2009, Początek życia człowieka - miłość czy in vitro? XXXIX Wrocławskie Dni Duszpasterskie "Misterium Miłości" 27-29 sierpnia 2009 , Wrocław, Polska.

  6. Cebrat S. 2009, Biologiczne argumenty przeciwko zapłodnieniu in vitro (u człowieka). Sympozjum Naukowe Papieskiego Wydziału Teologicznego, Swiętość ludzkiego życia. Wokół Instrukcji 3 marzec 2009, Wrocław, Polska.

  7. Cebrat S. 2009, Problemy neo-darwinizmu 150 lat po Darwinie. Od syntezy chemicznej do biologii syntetycznej. Konferencja dedykowana profesorowi Andrzejowi Legockiemu z okazji 70 rocznicy urodzin. 19-20 pazdziernika 2009, Poznań, Polska.

  8. Chrobak A., Szopa A., Rossowska J., Sobczyński M., Gabryś M. 2009, Flow cytometry as a potential instrument for non-invasive simple method of mild endometriosis diagnosis The 14th Leipziger Workshop: Cytomics and Regenerative Medicine and 7th International Workshop: Slide-Based Cytometry 2–4 April, Leipzig, Germany. Abstracts of the 14th Leipziger Workshop: Cytomics and Regenerative Medicine and 7th International Workshop: Slide-Based Cytometry, Cytometry Part A, Volume 75A (8) pp. 713

  9. Mackiewicz P., Wiszniowska T., Stefaniak K., Socha P., Olejniczak A. J., Nadachowski A. 2009, Analysis of dental enamel thickness in fossil bears Ursus spelaeus and U. wenzensis in comparison to selected representatives of mammals Paleontological Conference. Fossil Vertebrates – Morphology, Systematics, Evolution 3-5 December 2009, Wrocław, Polska. Abstracts pp. 37-38

  10. Rychta E., Brzostek A., Bacolla A., Mackiewicz P., Dziadek J. 2009, Unusual DNA structures as endogenous mutagen or the source of genetic instability in mycobacterial genome Machines on genes: enzymes that make, break, and move DNA and RNA. Biochemical Society Meeting 12 - 14 August 2009, Robinson College, Cambridge, United Kingdom.

  11. Rychta E., Brzostek A., Bacolla A., Mackiewicz P., Dziadek J. 2009, Unusual DNA structures as endogenous mutagen or the source of genetic instability in mycobacterial genome Konferencja: „Wyzwania współczesnej biologii komórki – genetyka molekularna, biologia systemów, bioinformatyka” (The Challenges of Contemporary Cell Biology – Molecular Genetics, System Biology, Bioinformatics) 20-21 April 2009, Łódz, Polska.

  12. Sochocka M., Zaczyńska E., Taboł A., Sobczyński M., Leszek J., Błach-Olszewska Z. 2009, Comparison of donapezil and Ginkgo biloba (EGb 761) effect on innate antiviral immunity of human leukocytes. VI Kongres Polskiego Towarzystwa Psychogeriatrycznego (PTPG) 3-4 grudnia 2009, Wrocław, Polska.

  13. Strzelecki J., Sobczyński M., Hryniewicz W., Sadowy E. 2009, Polymorphism of three selected virulence genes in Enterococcus faecalis. European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases 16-19 May 2009, Helsinki, Finland.

  14. Waga W. 2009, Sympatric speciation in populations distributed in uniformly changing environment. Physics and Competition of Conflicts, 1st annual meeting 28-30 May 2009, Rome, Italy. Abstracts pp. 54

  15. Wiszniowska T., Mackiewicz P., Socha P., Stefaniak K., Nowakowski D., Nadachowski A. 2009, Dental enamel structure in fossil bears Ursus spelaeus and U. wenzensis in comparison to different representatives of other Carnivora Paleontological Conference. Fossil Vertebrates – Morphology, Systematics, Evolution 3-5 December 2009, Wrocław, Polska. Abstracts pp. 67-68

2008

  1. Biecek P., Cebrat S. 2008, Why the Y chromosome shrinks and women live longer than men Systems Biology Seminar 27 07 2008, Aberdeen, Scotland.

  2. Biecek P. 2008, Wybrane zagadnienia związane z testowaniem zbioru hipotez o hierarchicznej strukturze zależności Seminaria statystyka matematyczna i inne zastosowania probabilistyczne. IMPAN 17 styczen 2008, Warszawa, Polska.

  3. Biecek P., Mackiewicz P., Mackiewicz D., Banaszak J., Cebrat S. 2008, Analysis of translation termination sites in prokaryotes Bioinformatics 2008 24-27 April 2008, Warszawa, Polska. Book of Abstracts pp. 7

  4. Biecek P. 2008, Projekt HapMap, prezentacja danych oraz przykładowe wyniki analizy sprzężeń pomiędzy loci Seminaria Biologii Obliczeniowej. Uniwersytet Warszawski 13 styczen 2008, Warszawa, Polska.

  5. Biecek P. 2008, Analiza sekwencji DNA w pobliżu miejsca terminacji translacji w różnych prokaryotach. Matematyczne metody biologii, seminarium UW 23 04 2008, Warszawa, Polska.

  6. Biecek P. 2008, Testing procedures for Hierarchically Related Hypotheses and some examples in functional genomics The 3rd Warsaw-Berlin Workshop on Computational Biology 7 marzec 2008, Berlin, Niemcy.

  7. Biecek P., Zagdanski A., Cebrat S. 2008, Improving the detection performance for gene set functional enrichment and transcription factor binding sites analysis RECOMB 2008 29 03 2008, Singapur, Singapur.

  8. Cebrat S., Waga W., Zawierta M. 2008, Non-monotonous relation between fecundity and kinship or relation between the crossover rate and inbreeding coefficient The Congress of Biochemistry and Cell Biology 7-11.09., Olsztyn, Polska. Acta Biochimica Polonica, 55(s3) pp. 38

  9. Cebrat S., Zawierta M., Waga W. 2008, Phase transition in the biological evolution Evolution and Physics, Concepts, Models and Applications 20 - 23. 01. 2008, Bad Honnef, Niemcy.

  10. Cebrat S. 2008, Ab-zymy i Lamarck Studium Generale 08.06.2008, Wrocław, Polska.

  11. Cebrat S., Biecek P. 2008, Why Y chromosome is short and women live longer than men Dynamics of Complex Systems 08 03 2008, Warszawa, Polska.

  12. Cebrat S., Zawierta M., Waga W. 2008, Modelling the relation between kinship and fertility 12th Evolutionary Biology Meeting at Marseilles 23 - 26 09 2008, Marseille, Francja.

  13. Cebrat S., Biecek P. 2008, Dlaczego chromosom Y jest krótki a kobiety żyją dłużej? Człowiek wobec masowych zjawisk społecznych 19 05 2008, Wrocław, Polska.

  14. Cebrat S., Zawierta M., Waga W. 2008, Modeling the evolution of eukaryotic chromosomes Polish-Russian Biotechnology Symposium 15-17. 10, Moscow, Russia.

  15. Cebrat S. 2008, Czy ewolucja ewoluuje Studium Generale 24.04.2008, Wrocław, Polska.

  16. Cebrat S. 2008, Problemy z zapłodnieniem in vitro UNESCO Chair of Interdysciplinary Studies 08 02 2008, Wrocław, Polska.

  17. Cebrat S., Zawierta M., Waga W., Bońkowska K., Mackiewicz D. 2008, The role of kinship in the fertility and genome and population evolution European Conference Mathematical and Theoretical Biology 29 07 2008, Edinburgh, Scotland.

  18. Cebrat S. 2008, Fecundity, kinship and genome structure Proteomics Meets Medicine 10.10.2008, Wrocław, Poland.

  19. Cebrat S. 2008, Ab-zymy i Lamarck Studium Generale 08.06.2008, Wrocław, Polska.

  20. Cebrat S., Biecek P. 2008, Evolution of sex chromosomes – why Y chromosome shrinks ECCS Jeruzalem 13 - 21 09. , Jerozolima, Izrael.

  21. Gisterek I., Matkowski R., Sedlaczek P., Szewczyk K., Staszek U., Biecek P., Lacko A., Bebenek M., Pudelko M., Kornafel J. 2008, Vascular Endothelial Growth Factor C serum levels in patients with breast cancer ESTRO27 14 September 2008, Goteborg, Sweden. Radiotherapy and Oncology, Journal of the European Society for Therapeutic Radiology and Oncology Volume 88 Supplement 2
    [Download]

  22. Mackiewicz P., Biecek P., Mackiewicz D., Kiraga J., Bączkowski K., Sobczyński M., Cebrat S. 2008, Optimisation of Asymmetric Mutational Pressure and Selection Pressure Around the Universal Genetic Code. Computational Science – ICCS 2008, 8th International Conference 23-25.06.2008, Kraków, Polska. Lecture Notes in Computer Science, 5103 pp. 100-109
    [Download]

  23. Mackiewicz P., Wyroba E. 2008, Evolution of Rab7 and Rab9 proteins. Bioinformatics 2008 Conference 24-27 April 2008, Warszawa, Polska. Book of Abstracts pp. 49

  24. Pitts N., Longbottom C., Hall A., Czajczynska-Waszkiewicz A., Łoś P., Masalski M., Biecek P., Christie A. 2008, Diagnostic Accuracy of an Optimised AC Impedance Device to Aid Caries Detection and Monitoring 55th ORCA 2008, Groningen, The Netherlands. Caries Res 2008;42:185-238 Vol 42. No 3 pp. 185-238
    [Download]

  25. Rychta E., Brzostek A., Bacolla A., Mackiewicz P., Dziadek J. 2008, Unusual DNA structures as endogenous mutagen or the source of genetic instability in mycobacterial genome Warsztaty Mikrobiot 2008, I Ogólnopolskie Warsztaty Mikrobiologia w Ochronie Zdrowia i Srodowiska 25-26 wrzesień 2008, Łódz, Polska.

  26. Rychta E., Brzostek A., Bacolla A., Mackiewicz P., Dziadek J. 2008, Unusual DNA structures as endogenous mutagen or the source of genetic instability in mycobacterial genome Międzynarodowa Konferencja Komitetu Mikrobiologii PAN, Wydziału II Nauk Biologicznych PAN i Szkoły Głównej Gospodarstwa Wiejskiego. Vaccines: plant biotechnology, cancer and infectious diseases therapy 28-29 November 2008, Warszawa, Polska.

  27. Rychta E., Brzostek A., Bacolla A., Mackiewicz P., Dziadek J. 2008, Niezwykłe struktury DNA. Wewnętrzny mutagen czy zródło zmienności genomu mykobakterii? Replikacja i segregacja bakteryjnego materiału genetycznego , Szczepanów, Polska.

  28. Rymaszewska J., Wojtynska R., Biecek P., Kustrzycki W., Dzielak K. 2008, Depression and anxiety of CABG patients - long-term follow-up European Psychiatry Volume 23, numero S2 April 2008, , France. Doi : 10.1016/j.eurpsy.2008.01.230 pp. 63
    [Download]

  29. Sieradzki A., Okolow T., Adamowski T., Kiejna A., Trafidlo E., Weyde W., Biecek P., Morawska N. 2008, Sleep disorders in patients with end-stage renal disease. European Psychiatry Volume 23, numero S2 April 2008, , France. Doi : 10.1016/j.eurpsy.2008.01.591 pp. 280-281
    [Download]

  30. Sobczyński M., Mackiewicz P., Cebrat S. 2008, Relationship between amino acid composition and ecological properties of Prokaryotes. Bioinformatics 2008 Conference 24-27.04.2008, Warszawa, Polska. Book of Abstracts pp. 77

  31. Sobczyński M., Mackiewicz P., Lipiński P., Cebrat S. 2008, The application of Self Organizing Maps and evolutionary algorithms to distinguish bacterial proteomes. 7th World Congress in Probability and Statistics 14 – 19, July, 2008, , Singapore. Program, Abstracts and Directory of Participants pp. 188-189

  32. Waga W., Zawierta M. 2008, Sympatric speciation in populations with high inbreeding coefficient Evolution and Physics, Concepts, Models and Applications 20 - 23. 01. 2008, Bad Honnef, Niemcy.

  33. Zawierta M., Waga W. 2008, Sympatric speciation in panmictic populations Evolution and Physics, Concepts, Models and Applications 20 - 23. 01. 2008, Bad Honnef, Niemcy.

  34. Zynek-Litwin M., Kuzniar J., Marchewka Z., Kopec W., Kusztal L., Szymanska B., Patrzalek D., Biecek P., Klinger M. 2008, Neutrophils degranulation marker - leucocyte elastase-A1protease inhibitor complex: a comparative study with classic (A1M, B2M) and novel (NGAL, IL-18) kidney graft injury markers. Transplantation. 86(2S) Supplement:359 27 July 2008, Sydney, Australia. Transplantation
    [Download]

  35. Zynek-Litwin M., Kuzniar J., Marchewka Z., Kopec W., Kusztal L., Patrzalek D., Biecek P., Dlugosz A., Klinger M. 2008, Transplantation. 86(2S) Supplement:308 Transplantation 27 July 2008, Sydney, Australia. Transplantation
    [Download]

2007

  1. Bączkowski K., Nevozhay D.Dmitry , Kiraga J., Biecek P., Mackiewicz P., Cebrat S. 2007, Generowanie długich ramek odczytu przez geny w genomach prokariotycznych. II Polski Kongres Genetyki 18-20 September 2007, Warszawa, Polska. Streszczenia pp. 282-283

  2. Biecek P. 2007, Detekcje wielowymiarowych interakcji wykorzystując metody analizy skupień II Polski Kongres Genetyki 17 wrzesien 2007, Warszawa, Polska.

  3. Biecek P. 2007, Zastosowania statystyki i informatyki w genomice i badaniach dynamiki populacji. Seminaria Matematyczne metody biologii. Uniwersytet Warszawski 12 grudzien 2007, Warszawa, Polska.

  4. Biecek P., Susłowicz K., Mackiewicz P., Mackiewicz D., Kiraga J., Cebrat S. 2007, Analiza składu nukleotydowego i kodonowego w okolicach sygnału stop translacji w genomach prokariotycznych. II Polski Kongres Genetyki 18-20 September 2007, Warszawa, Polska. Streszczenia pp. 289-290

  5. Bońkowska K., Kula M., Biecek P., Cebrat S. 2007, Pandemics and immune memory in the noisy Penna model. SPIE Conference, Noise and Fluctuations in Biological, Biophysical and Biomedical Systems 20-24 May 2007, Florence, Italy.

  6. Bońkowska K., Cebrat S. 2007, Modeling the age structured population without the logistic equation of Verhulst. How to bridge theoretical predictions to empirical data. , Torino, Italy.

  7. Cebrat S. 2007, Symulacje komputerowe ewolucji genom??w. II Polski Kongres Genetyki 18-20 September 2007, Warszawa, Polska.

  8. Cebrat S., Waga W., Zawierta M., Mackiewicz D. 2007, Interplay between Inbreeding and Intragenomic Recombination Responsible for Sympatric Speciation. Genetic and Biological Networks, ECCS ‘07 , Dresden, Germany.

  9. Cebrat S. 2007, Modeling the evolution of age structured populations and ageing processes. From Genetics to Mathematics, MCRTN Marie Curie Research Training Network , Zbąszyń, Polska.

  10. Cebrat S. 2007, Strategy of genome evolution in the expanding populations. Evolutionary Computation and Global Optimization 2007 Conference 11-14 June 2007, Będlewo, Polska.

  11. Cebrat S. 2007, Phenomena associated with sympatric speciation in the expanding populations. Max Born 23 , Polanica-Zdrój, Polska.

  12. Cebrat S. 2007, Genome evolution during speciation. From Genetics to Mathematics, MCRTN Marie Curie Research Training Network , Zbąszyń, Polska.

  13. Cebrat S. 2007, Sympatric speciation and population expansion. COST ’07 , Palermo, Italy.

  14. Cebrat S. 2007, Optimisation of asymmetric mutational pressure and selection pressure around the universal genetic code. From Genetics to Mathematics, MCRTN Marie Curie Research Training Network , Zbąszyń, Polska.

  15. Cebrat S., Biecek P., Bońkowska K. 2007, White noise and synchronization shaping the age structure of the human population. SPIE Conference, Noise and Fluctuations in Biological, Biophysical and Biomedical Systems 20-24 May 2007, Florence, Italy.

  16. Kiewra D., Sobczyński M. 2007, Ryzyko zakażenia krętkami Borrelia burgdorferi na terenia Wrocławia i Slężańskiego Parku Krajobrazowego. IX Miedzynarodowe Sympozjum Stawonogi Pasożytnicze, Alergogenne i Jadowite Znaczenie Medyczne i Sanitarne 15-18 May 2007, Kazimierz Dolny, Polska.

  17. Łoś P., Pitts N., Longbottom C., Hall A., Czajczynska-Waszkiewicz A., Masalski M., Biecek P., Kochan S. 2007, Ac-Impedance Spectroscopy technique for the detection of dental caries in human teeth 54th Annual ORCA Congress 2007, Helsingor , Denmark. Caries Res. 2007 Vol.41 nr 4; s.296-297 poz.80, Abstracts of the 54th Annual ORCA Congress pp. 296-297

  18. Mackiewicz P., Moszczyński K., Bodył A. 2007, Phylogenetic and structural analysis of the pecuilar plastid genome of Adenoides eludens (Dinoflagellata). The 10th International Colloquium on Endocytobiology and Symbiosis 10-13 September 2007, Gmunden, Austria. Book of Abstracts pp. 42

  19. Mackiewicz D., Kiraga J., Mackiewicz P., Biecek P., Bączkowski K., Cebrat S. 2007, Zależność między punktem izoelektrycznym białek proteomów bakterii a warunkami ich życia. II Polski Kongres Genetyki 18-20 September 2007, Warszawa, Polska. Streszczenia pp. 104-105

  20. Mackiewicz D., Waga W., Cebrat S. 2007, Computer modeling of genome evolution during sympatric speciation. COST "Global versus local dynamics on networks", ECCS ’07 , Dresden, Germany.

  21. Mackiewicz P., Wyroba E. 2007, Analiza filogenetyczna i taksonomiczna białek Rab7 i Rab9. II Polski Kongres Genetyki 18-20 September 2007, Warszawa, Polska. Streszczenia pp. 228

  22. Mackiewicz P., Moszczyński K., Bodył A. 2007, Analiza strukturalna i ewolucja osobliwego genomu plastydowego bruzdnicy Adenoides eludens (Dinoflagellata). II Polski Kongres Genetyki 18-20 September 2007, Warszawa, Polska. Streszczenia pp. 82-83

  23. Rydzanicz K., Sobczyński M. 2007, Szacowanie wpływu środowiska na efektywność działania mikrobiologicznych larwicydów wobec komarów Culex pipiens molestus. IX Miedzynarodowe Sympozjum Stawonogi Pasożytnicze, Alergogenne i Jadowite Znaczenie Medyczne i Sanitarne 15-18 May 2007, Kazimierz Dolny, Polska.

  24. Sobczyński M., Mackiewicz P., Lipiński P., Cebrat S. 2007, Zastosowanie sieci Kohonena i algorytmów ewolucyjnych do różnicowania proteomów prokariotycznych. II Polski Kongres Genetyki 18-20 September 2007, Warszawa, Polska. Streszczenia pp. 283-284

  25. Sobczyński M., Mackiewicz P., Cebrat S. 2007, Zależności między składem aminokwasowym proteomów prokariotycznych a ich filogenezą i właściwościami ekologicznymi. II Polski Kongres Genetyki 18-20 September 2007, Warszawa, Polska. Streszczenia pp. 283

  26. Waga W., Mackiewicz D., Zawierta M., Cebrat S. 2007, Modeling the genetic phenomena responsible for sympatric speciation. Statphys 23 , Genua, Italy.

  27. Waga W., Mackiewicz D., Zawierta M., Bońkowska K., Cebrat S. 2007, Inbreeding and crossover rate determine space for life. How to bridge theoretical predictions to empirical data , Torino, Italy.

  28. Waga W., Cebrat S. 2007, How the local, limited interactions affect the evolution? Erice ’07 Statistical physics of social dynamics: opinions, semiotic dynamics, language. , Erice, Italy.

  29. Zaczyńska E., Czarny A., Jankowska E. A., Sobczyński M., Ponikowski P. 2007, NF-kappa-B expression in mononuclear cells from patients with chronic heart failure that observed in endotoxin tolerance. IV Konferencja Naukowo- Szkoleniowa Immunomodulacja: badania doświadczalne i kliniczne. 25-26 May 2007, Jurata, Polska.

2006

  1. Banaszak J., Mackiewicz P., Mackiewicz D., Kowalczuk M., Sobczyński M., Cebrat S. 2006, The isoelectric point of proteomes and the ecology of organisms. The 2nd FEMS Congress of European Microbiologists 4-8 July 2006, Madrid, Spain. Scientific Programme, P.GAP.3 pp. 69

  2. Bodył A., Mackiewicz P. 2006, Analysis of the targeting sequences of an iron-containing superoxide dismutase (SOD) gene of the dinoflagellate Lingulodinium polyedrum suggests function in multiple cellular compartments. The 16th Meeting of the International Society for Evolutionary Protistology 1-5 August 2006, Wrocław, Polska. Abstract Book pp. 32

  3. Bońkowska K., Biecek P., Cebrat S. 2006, Why does the age structure of human population change? Annual Meeting COST Action P10. Physics of Risk 13-16 May 2006, Vilnius, Lithuania.

  4. Cebrat S. 2006, Nielosowe procesy mutacji i rekombinacji w procesie ewolucji. KSI UNESCO 27 October 2006, Wrocław, Polska.

  5. Cebrat S. 2006, Ageing and population evolution. Trinity College Seminars 10 February 2006, Dublin, Ireland.

  6. Cebrat S., Biecek P. 2006, Relations between organisms and environment in the ageing process. 2nd International Conference Management of Risk Factors 2 (MARF2) 31 August - 3 September 2006, Rome, Italy.

  7. Cebrat S., Zawierta M., Wolfigiel M., Biecek P. 2006, Evolution of relation between mutation and recombinantion rates. Oxford, ECSS and GIACS CRP Forum Conferences 25–30 September 2006, Oxford, United Kingdom.

  8. Cebrat S. 2006, Chaos, genetic defects and population evolution. Winter School: Application of genomics and bioinformatics in animal biotechnology. 1-3 February 2006, Jastrzębiec, Polska.

  9. Cebrat S., Zawierta M., Wolfigiel M., Biecek P. 2006, Monte Carlo Simulation of Evolvability The 10th Evolutionary Biology Meeting at Marseilles 20-22 September 2006, Marseilles, France.

  10. Cebrat S. 2006, Modelowanie procesów starzenia i dynamiki populacji metodą Monte Carlo. Seminaria Biologii Obliczeniowej. Uniwersytet Warszawski 12 June 2006, Warszawa, Polska.

  11. Polak N., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Mackiewicz D., Smolarczyk K., Bączkowski K., Dudek M. R., Cebrat S. 2006, Relations between genes´ length and the rate of their divergence. The 2nd FEMS Congress of European Microbiologists 4-8 July 2006, Madrid, Spain. Scientific Programme, P.GAP.35 pp. 71

  12. Smolarczyk K. 2006, Symulacja Monte Carlo ewolucji genów i genomów, czyli tempo dywergencji w zależności od częstości mutacji i wielkości populacji. Warsztaty Biologii Ewolucyjnej Komitetu Biologii Ewolucyjnej i Teoretycznej PAN 25 February 2006, Warszawa, Polska.

2005

  1. Banaszak J., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Mackiewicz D., Polak N., Smolarczyk K., Dudek M. R., Cebrat S. 2005, The ecology of bacteria and isoelectric point of their proteomes. The 40th Meeting of the Polish Biochemical Society 19-23 September 2005, Lublin, Polska. Acta Biochimica Polonica 52, Suppl. 1/2005 pp. 7

  2. Banaszak J., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Polak N., Sobczyński M., Dudek M. R., Cebrat S. 2005, Dywergencja sekwencji a wartość punktu izoelektrycznego białka. Konferencja: Genomika i mikromacierze w biologii i medycynie. 25-28 June 2005, Sucha Beskidzka, Polska. Program – Streszczenia - Indeks autorów pp. 13

  3. Banaszak J., Mackiewicz P., Mackiewicz D., Smolarczyk K., Bączkowski K., Dudek M. R., Cebrat S. 2005, Długość białek a punkt izoelektryczny – analizy proteomów i symulacje komputerowe. Konferencja: Genomika i mikromacierze w biologii i medycynie. 25-28 June 2005, Sucha Beskidzka, Polska. Program – Streszczenia - Indeks autorów pp. 14

  4. Banaszak J., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Mackiewicz D., Polak N., Smolarczyk K., Dudek M. R., Cebrat S. 2005, Isoelectric point of proteins under the mutational pressure. Genes, Genomes and Populations Evolution 29 September - 2 October 2005, Wrocław, Polska.

  5. Banaszak J., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Mackiewicz D., Polak N., Smolarczyk K., Sobczyński M., Bączkowski K., Dudek M. R., Cebrat S. 2005, How proteins evolve under selection for their isoelectric point - computer simulations. The 10th Congress European Society for Evolutionary Biology. 15-20 August 2005, Kraków, Polska. Abstract Book pp. 299

  6. Bączkowski K., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Mackiewicz D., Polak N., Smolarczyk K., Banaszak J., Sobczyński M., Dudek M. R., Cebrat S. 2005, Optimisation of the Genetic Code. The 10th Congress European Society for Evolutionary Biology. 15-20 August 2005, Kraków, Polska. Abstract Book pp. 298

  7. Cebrat S. 2005, Od struktury demograficznej do struktury genomów w modelowaniu komputerowym. Konferencja: Genomika i mikromacierze w biologii i medycynie. 25-28 June 2005, Sucha Beskidzka, Polska.

  8. Cebrat S., Masa M., Stauffer D. 2005, Telomeres, life expectancy and RISK of cancer. COST Action Meeting 24 April 2005, Toledo, Spain.

  9. Cebrat S. 2005, The role of crossing-over in the computer simulated populations. Gliwice Scientific Meetings 18-19 November 2005, Gliwice, Polska.

  10. Cebrat S. 2005, How selection modulates mutational pressure? Application of genomics and bioinformatics in animal biotechnology 30 January 2005, Jastrzębiec, Polska.

  11. Cebrat S. 2005, Simulations of the inside introns recombinations. Genes, Genomes, Populations Evolution 29 September - 2 October 2005, Wrocław, Polska.

  12. Cebrat S. 2005, Genomic walks Geometry of Genome 22-24 September 2005, Leicester, United Kingdom.

  13. Dudek M. R., Cebrat S., Mackiewicz P., Kowalczuk M. 2005, Segmentation profiles of DNA sequences. Genes, Genomes and Populations Evolution 29 September - 2 October 2005, Wrocław, Polska.

  14. Godowska W., Mackiewicz P., Polak N., Mackiewicz D., Kowalczuk M., Dudek M. R., Cebrat S. 2005, Wnioskowanie o presji mutacyjnej na podstawie używalności kodonów stop translacji w genomach bakteryjnych. Konferencja: Genomika i mikromacierze w biologii i medycynie. 25-28 June 2005, Sucha Beskidzka, Polska. Program – Streszczenia - Indeks autorów pp. 27

  15. Mackiewicz D., Nowicka A., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Banaszak J., Cebrat S., Dudek M. R. 2005, Relation between amino acid frequencies and their relative substitution rates under mutation pressure and selection pressure. The International Conference Sequence-Structure-Function Relationships; Theoretical and Experimental Approaches 6-10 April 2005, Warszawa, Polska. Abstracts pp. 25

  16. Mackiewicz P., Bodył A. 2005, Organisation and diversity of the targeting signals of proteins imported into plastids with three envelope membranes. The International Conference Sequence-Structure-Function Relationships; Theoretical and Experimental Approaches 6-10 April 2005, Warszawa, Polska. Abstracts pp. 26

  17. Mackiewicz P. 2005, Influence of replication of DNA on organization and evolution of bacterial genomes. The 40th Meeting of the Polish Biochemical Society 19-23 September 2005, Lublin, Polska. Acta Biochimica Polonica 52, Suppl. 1/2005 pp. 5-6

  18. Mackiewicz P., Bodył A. 2005, Analiza bioinformatyczna sekwencji kierujących białka do plastydów trójbłonowych. Konferencja: Genomika i mikromacierze w biologii i medycynie. 25-28 June 2005, Sucha Beskidzka, Polska. Program – Streszczenia - Indeks autorów pp. 15

  19. Sobczyński M., Bączkowski K., Mackiewicz P., Cebrat S. 2005, Non-random distribution of genes of different length on prokaryotic chromosomes. The International Conference Sequence-Structure-Function Relationships; Theoretical and Experimental Approaches 6-10 April 2005, Warszawa, Polska. Abstracts pp. 37

  20. Sobczyński M., Mackiewicz P., Bączkowski K., Cebrat S. 2005, Genes of different length are non-randomly distributed on prokaryotic chromosomes. The 40th Meeting of the Polish Biochemical Society 19-23 September 2005, Lublin, Polska. Acta Biochimica Polonica 52, Suppl. 1/2005 pp. 25

2004

  1. Banaszak J. 2004, Selection pressure on isoelectric point of proteins. Herbstseminar in Chribska "Bioinformatics and Biochemistry" October 2004, Chribska, Czech Republic.

  2. Banaszak J., Mackiewicz P., Polak N., Kowalczuk M., Mackiewicz D., Smolarczyk K., Dudkiewicz M., Dudek M. R., Cebrat S. 2004, Punkt izoelektryczny białek – analizy proteomów i symulacje komputerowe. Polski Kongres Genetyki, XV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego, IV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetyki Człowieka 6-9 September 2004, Gdańsk, Polska. Streszczenia pp. 206-207

  3. Bartkowiak A., Cebrat S., Mackiewicz P. 2004, Probabilistic PCA and neural networks in search of representative features for some yeast genome data. The Symposium On Methods Of Artificial Intelligence AI-Meth 2004 and The Workshop On Knowledge Acquisition In Mechanical Engineering 17-19 November 2004, Gliwice, Polska. Proceedings Of The Symposium On Methods Of Artificial Intelligence AI-Meth 2004 and The Workshop On Knowledge Acquisition In Mechanical Engineering pp. 17-18
    [Download]

  4. Bączkowski K., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Dudek M. R., Cebrat S. 2004, Poszukiwanie sekwencji kodujących wsród krótkich ORFów w genomie drożdży Saccharomyces cerevisiae. Polski Kongres Genetyki, XV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego, IV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetyki Człowieka 6-9 September 2004, Gdańsk, Polska. Streszczenia pp. 207

  5. Bocer T., Wołoszyńska M., Mackiewicz P., Jańska H. 2004, The fragment of the chloroplast DNA was acquired by bean mitochondrial genome by horizontal DNA transfer. The 29th Meeting of the Federation of the Biochemical Societies 26 June - 1 July 2004, Warszawa, Polska. EJB, The FEBS Journal 271 (suppl. 1) pp. 213

  6. Cebrat S. 2004, Concert of the mutational and selection pressure on the genetic code. Computational and Mathematical Population Dynamics 7 Destobio 3 21-25 June 2004, Trento, Italy.

  7. Cebrat S. 2004, Introns, gamete preselection and two meiotic divisions in sex reproduction. Herbstseminar in Chribska "Bioinformatics and Biochemistry" October 2004, Chribska, Czech Republic.

  8. Cebrat S. 2004, Monte Carlo simulations of genes, genome and populations evolution. I Conference of COST Action P10 – Physics of Risk. April 2004, Nyborg, Denmark.

  9. Cebrat S., Pękalski A. 2004, The Role of Dominant Mutations in the Population Expansion. Computational Science – ICCS 6-9 June 2004, Kraków, Polska. Lecture Notes in Computer Science 3039 pp. 765-770

  10. Cebrat S. 2004, Gene evolution under directional, asymmetric mutational pressure. Workshop Application of Genomics and Bioinformatics in Animal Biotechnology 3 February 2004, Sucha Beskidzka, Polska.

  11. Cebrat S., Radomski J. P., Stauffer D. 2004, Genetic Paralog Analysis and Simulations. Computational Science – ICCS 6-9 June 2004, Kraków, Polska. Lecture Notes in Computer Science 3039 pp. 709-717

  12. Mackiewicz P., Dudkiewicz M., Kowalczuk M., Mackiewicz D., Banaszak J., Polak N., Smolarczyk K., Nowicka A., Dudek M. R., Cebrat S. 2004, Differential Gene Survival under Asymmetric Directional Mutational Pressure. Computational Science – ICCS 6-9 June 2004, Kraków, Polska. Lecture Notes in Computer Science 3039 pp. 687-693

  13. Mackiewicz D., Polak N. 2004, Simulation and analyses of the gene sequence divergence. Herbstseminar in Chribska "Bioinformatics and Biochemistry" October 2004, Chribska, Czech Republic.

  14. Mackiewicz P., Zakrzewska-Czerwińska J., Zawilak A., Dudek M. R., Cebrat S. 2004, Reguły wyznaczania regionu inicjacji replikacji w genomach bakteryjnych. Polski Kongres Genetyki, XV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego, IV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetyki Człowieka 6-9 September 2004, Gdańsk, Polska. Streszczenia pp. 189-190

  15. Mackiewicz P. 2004, Identyfikowanie regionu inicjacji replikacji chromosomów bakterii in silico. Seminarium z cyklu "Obliczeniowa biologia", w ramach Centrum Zastosowań Matematyki, Instytutu Matematycznego PAN 15 November 2004, Warszawa, Polska.

  16. Polak N., Banaszak J., Mackiewicz P., Dudkiewicz M., Kowalczuk M., Mackiewicz D., Smolarczyk K., Nowicka A., Dudek M. R., Cebrat S. 2004, How Gene Survival Depends on Their Length. Computational Science – ICCS 6-9 June 2004, Kraków, Polska. Lecture Notes in Computer Science 3039 pp. 694-699

  17. Polak N., Mackiewicz P., Banaszak J., Dudkiewicz M., Kowalczuk M., Mackiewicz D., Smolarczyk K., Dudek M. R., Cebrat S. 2004, Zależność stabilności genów od ich długości. Polski Kongres Genetyki, XV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego, IV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetyki Człowieka 6-9 September 2004, Gdańsk, Polska. Streszczenia pp. 205-206

  18. Smolarczyk K., Mackiewicz P., Polak N., Banaszak J., Dudkiewicz M., Kowalczuk M., Mackiewicz D., Dudek M. R., Cebrat S. 2004, Ewolucja genów w asymetrycznych genomach bakteryjnych. Polski Kongres Genetyki, XV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego, IV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetyki Człowieka 6-9 September 2004, Gdańsk, Polska. Streszczenia pp. 206

  19. Wołoszyńska M., Bocer T., Mackiewicz P., Jańska H. 2004, A fragment of chloroplast DNA was transferred horizontally from magnoliids to mitochondrial genome of Phaseolus. Gordon Research Conference Mitochondria & Chloroplasts 25-30 July 2004, Kimball Union Academy Meriden, USA.

2003

  1. Bartkowiak A., Szustalewicz A., Cebrat S., Mackiewicz P. 2003, Kohonen's self-organizing maps in visualizing of some yeast DNA data. LX Scientific Session of the Polish Biometric Society 5 December 2003, Poznań, Polska. Listy Biometryczne – Biometrical Letters 40(2) pp. 85

  2. Dudkiewicz M., Mackiewicz P., Nowicka A., Kowalczuk M., Mackiewicz D., Polak N., Smolarczyk K., Banaszak J., Dudek M. R., Cebrat S. 2003, Evolution of protein coding sequences under directional mutational pressure. The XVII Max Born Symposium 22-25 September 2003, Lądek-Zdrój, Polska. Book of Abstracts pp. 14

  3. Dudkiewicz M., Mackiewicz P., Nowicka A., Kowalczuk M., Mackiewicz D., Polak N., Smolarczyk K., Dudek M. R., Cebrat S. 2003, Properties of Genetic Code under Directional, Asymmetric Mutational Pressure. Computational Science – ICCS 2-4 June 2003, St. Petersburg, Russia. Lecture Notes in Computer Science 2657 pp. 343-350

  4. Kowalczuk M., Dudkiewicz M., Polak N., Dudek M. R., Cebrat S. 2003, Asymmetric mutational pressure associated with replication and strategy of gene evolution. XIX International Congress of Genetics 6-11 July 2003, Melbourne, Australia. Book of Abstracts pp. 138

  5. Mackiewicz P., Mackiewicz D., Nowicka A., Smolarczyk K., Łaszkiewicz A. 2003, Gene inversions and rate of their divergence. XIX International Congress of Genetics 6-11 July 2003, Melbourne, Australia. Book of Abstracts pp. 24

  6. Nowicka A., Mackiewicz P., Dudkiewicz M., Mackiewicz D., Kowalczuk M., Cebrat S., Dudek M. R. 2003, Correlation between mutation pressure, selection pressure and occurrence of amino acids. Computational Science – ICCS 2-4 June 2003, St. Petersburg, Russia. Lecture Notes in Computer Science 2658 pp. 650-657

2002

  1. Bartkowiak A., Szustalewicz A., Cebrat S., Mackiewicz P. 2002, Visualization of coding and not-coding pieces of DNA using vector quantization and self organizing maps. The XXIth International Biometric Conference 21-26 July 2002, Freiburg, Germany. Proceedings – Abstracts of Special and contributed Paper Presentations pp. 171-172

  2. Cebrat S., Szymczak S., Łaszkiewicz A. 2002, Przewidywanie zmian struktury wiekowej populacji w modelu Penna. XXXI Ogólnopolska Konferencja Zastosowań Matematyki 17-24 September 2002, Zakopane, Polska.

  3. Cebrat S., Kowalczuk M., Mackiewicz P., Mackiewicz D. 2002, The role of intergenic sequences in the genomes of sexually reproducing organisms. Polish-Japanese Bilateral Seminar on Bioinformatics 24-25 June 2002, Poznań, Polska.

  4. Cebrat S., Szymczak S., Łaszkiewicz A. 2002, Prediction of the Human Life Expectancy International Workshop on Complex Systems in Natural and Social Sciences 26-29 September 2002, Matrafured, Hungary.

  5. Cebrat S., Mackiewicz P., Mackiewicz D., Kowalczuk M. 2002, Aproksymowanie liczby genów w genomach prokariotycznych. XXXI Ogólnopolska Konferencja Zastosowań Matematyki 17-24 September 2002, Zakopane, Polska.

  6. Kowalczuk M., Mackiewicz P., Mackiewicz D., Nowicka A., Dudkiewicz M., Łaszkiewicz A., Dudek M. R., Cebrat S. 2002, From mutational pressure to structure of genomes. XXXVIII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego 18-22 September 2002, Wrocław, Polska. Streszczenia pp. 197-198

  7. Kowalczuk M., Mackiewicz P., Smolarczyk K., Dudek M. R., Cebrat S. 2002, Testowanie tablic mutacji dla genomów prokariotycznych. XXXVIII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego 18-22 September 2002, Wrocław, Polska. Streszczenia pp. 210-211

  8. Kowalczuk M., Mackiewicz P., Polak N., Nowicka A., Dudek M. R., Cebrat S. 2002, Tworzenie tablic mutacji dla genomów prokariotycznych. XXXVIII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego 18-22 September 2002, Wrocław, Polska. Streszczenia pp. 210

  9. Kowalczuk M., Mackiewicz P., Polak N., Smolarczyk K., Dudek M. R., Cebrat S. 2002, Presja mutacyjna w genomach prokariotycznych. Konferencja naukowa "Biotechnologia w Polsce" 25-28 September 2002, Gdańsk, Polska.

  10. Łaszkiewicz A., Szymczak S., Cebrat S. 2002, Speciation effect in the Penna model. Conference on Mathematical Modelling of Population Dynamics 24-28 June 2002, Będlewo, Polska.

  11. Łaszkiewicz A., Szymczak S., Cebrat S. 2002, Jak przyłapać starość na gorącym uczynku, czyli symulacje Monte Carlo dynamiki populacji. Konferencja naukowa "Biotechnologia w Polsce" 25-28 September 2002, Gdańsk, Polska.

  12. Łaszkiewicz A., Szymczak S., Cebrat S. 2002, Higher mortality of the youngest organisms predicted by the Penna ageing model. Conference on Mathematical Modelling of Population Dynamics 24-28 June 2002, Będlewo, Polska.

  13. Mackiewicz P., Mackiewicz D., Kowalczuk M., Banaszak J., Cebrat S. 2002, Symetria procesów rekombinacyjnych w genomach prokariotycznych. XXXVIII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego 18-22 September 2002, Wrocław, Polska. Streszczenia pp. 213

  14. Mackiewicz P., Mackiewicz D., Dudek M. R., Cebrat S. 2002, Wysokie tempo dywergencji blisko spokrewnionych genomów bakterii. Konferencja naukowa "Biotechnologia w Polsce" 25-28 September 2002, Gdańsk, Polska.

  15. Mackiewicz D., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Dudek M. R., Cebrat S. 2002, Tempo translokacji genów między nićmi DNA. XXXVIII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego 18-22 September 2002, Wrocław, Polska. Streszczenia pp. 212

  16. Mackiewicz D., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Dudek M. R., Cebrat S. 2002, Rearanżacje pomiędzy nicią wiodącą i opózniającą w genomach bakteryjnych. Konferencja naukowa "Biotechnologia w Polsce" 25-28 September 2002, Gdańsk, Polska.

  17. Mackiewicz D., Mackiewicz P., Nowicka A., Dudek M. R., Cebrat S. 2002, Wpływ historii genów na strukturę drzew filogenetycznych. XXXVIII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego 18-22 September 2002, Wrocław, Polska. Streszczenia pp. 212

  18. Mackiewicz P., Kowalczuk M., Mackiewicz D., Dudek M. R., Cebrat S. 2002, Kodujące właściwości genomu drożdży Saccharomyces cerevisiae. XXXVIII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego 18-22 September 2002, Wrocław, Polska. Streszczenia pp. 213

  19. Mackiewicz P., Łaszkiewicz A., Dudkiewicz M., Dudek M. R., Cebrat S. 2002, Ocena modeli ewolucji sekwencji nukleotydowych do określania odległości między sekwencjami. XXXVIII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego 18-22 September 2002, Wrocław, Polska. Streszczenia pp. 209-210

  20. Mackiewicz P., Mackiewicz D., Kowalczuk M., Dudek M. R., Cebrat S. 2002, Przyczyny różnic w tempie dywergencji genów bakterii. XXXVIII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego 18-22 September 2002, Wrocław, Polska. Streszczenia pp. 211

  21. Nowicka A., Duda A., Dudek M. R. 2002, Effect of variable surrounding on species creation. Conference on Mathematical Modelling of Population Dynamics 24-28 June 2002, Będlewo, Polska.

  22. Nowicka A., Dudek M. R. 2002, Wpływ zmiennych warunków środowiska na strukturę genetyczną gatunków. Konferencja naukowa "Biotechnologia w Polsce" 25-28 September 2002, Gdańsk, Polska.

  23. Stauffer D., Dudkiewicz M., Cebrat S. 2002, Geneza paralogów w genomach haploidalnych. Konferencja naukowa ”Biotechnologia w Polsce” 25-28 September 2002, Gdańsk, Polska.

  24. Stauffer D., Dudkiewicz M., Cebrat S. 2002, Redundancja informacji w genomach. XXXVIII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego 18-22 September 2002, Wrocław, Polska. Streszczenia pp. 214

  25. Team of Department of Genomics . 2002, Approximation of the coding capacity of genomes. Partners in Project FP6. November, Aalborg, Denmark. Abstract Bio 002 pp. 32-33

2001

  1. Dudkiewicz M., Mackiewicz P., Szczepanik D., Dudek M. R., Cebrat S. 2001, Zastosowanie proteomów do badania odleglości filogenetycznej między bakteriami. XIV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego 11-13 June 2001, Poznań, Polska. Streszczenia pp. 103

  2. Kowalczuk M., Mackiewicz P., Nowicka A., Dudek M. R., Cebrat S. 2001, ORFy krótsze niż 100 kodonów w genomie Saccharomyces cerevisiae. XIV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego 11-13 June 2001, Poznań, Polska. Streszczenia pp. 107

  3. Kowalczuk M., Mackiewicz P., Dudek M. R., Cebrat S. 2001, Precyzyjne prawo ewolucji genomów. XIV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego 11-13 June 2001, Poznań, Polska. Streszczenia pp. 60

  4. Kurdziel A., Cebrat S. 2001, Rola sprzężeń genetycznych w komputerowo symulowanych populacjach. XIV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego 11-13 June 2001, Poznań, Polska. Streszczenia pp. 62

  5. Mackiewicz P., Szczepanik D., Kowalczuk M., Dudek M. R., Cebrat S. 2001, Szacowanie liczby genów w genomach prokariotycznych. XIV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego 11-13 June 2001, Poznań, Polska. Streszczenia pp. 112

  6. Mackiewicz P., Kowalczuk M., Gierlik A., Szczepanik D., Nowicka A., Łaszkiewicz A., Dudek M. R., Cebrat S. 2001, Replication Associated Mutational Pressure Generating Long Range Correlation in DNA. Conference: “Horizons in Complex Systems” 5-9 December 2001, Messina, Italy.

  7. Mackiewicz P., Szczepanik D., Nowicka A., Polak N., Dudek M. R., Cebrat S. 2001, Zróżnicowane tempo zabijania genów w zależności od ich położenia na chromosomie. XIV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego 11-13 June 2001, Poznań, Polska. Streszczenia pp. 118

  8. Mackiewicz P., Kowalczuk M., Szczepanik D., Dudek M. R., Cebrat S. 2001, Number and coding probability of short ORFs in the Saccharomyces cerevisiae genome. The 20th International Conference on Yeast Genetics and Molecular Biology 26-31 August 2001, Prague, Czech Republic. Yeast 18 pp. 106

  9. Nowicka A., Kowalczuk M., Mackiewicz P., Dudkiewicz M., Dudek M. R., Cebrat S. 2001, Presja mutacyjna w genomie Borrelia burgdorferi. XIV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego 11-13 June 2001, Poznań, Polska. Streszczenia pp. 114

  10. Szczepanik D., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Smolarczyk K., Dudek M. R., Cebrat S. 2001, Zróżnicowane tempo ewolucji genów w genomach bakteryjnych XIV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego 11-13 June 2001, Poznań, Polska. Streszczenia pp. 118

2000

  1. Dudkiewicz M., Szczepanik D., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Stojek E., Dudek M. R., Cebrat S. 2000, Application of proteomes for investigation of phylogenetic distance between bacteria. The 24th Congress of the Polish Society of Microbiologists 12-15 September 2000, Białystok, Polska. Med. Sci. Monit. 6, Suppl. 3, G/P-2 pp. 151

  2. Gierlik A., Mackiewicz P., Szczepanik D., Kowalczuk M., Nowicka A., Dudek M. R., Cebrat S. 2000, Effect of selection pressure on the asymmetry of coding and non-coding sequences. The 24th Congress of the Polish Society of Microbiologists 12-15 September 2000, Białystok, Polska. Med. Sci. Monit. 6, Suppl. 3, G/P-4 pp. 152

  3. Kowalczuk M., Mackiewicz P., Gierlik A., Szczepanik D., Nowicka A., Dudek M. R., Cebrat S. 2000, Thousands of noncoding ORFs in the yeast genome. Yeast Genetics and Molecular Biology Meeting 25-30 July 2000, Seattle, USA. Book of Abstracts S50 pp. 61

  4. Kowalczuk M., Dudkiewicz M., Nowicka A., Mackiewicz P., Dudek M. R., Cebrat S. 2000, Simulation of asymmetric mutation pressure in Borrelia burgdorferi genome. The 24th Congress of the Polish Society of Microbiologists 12-15 September 2000, Białystok, Polska. Med. Sci. Monit. 6, Suppl. 3, G/P-5 pp. 152

  5. Mackiewicz P., Kowalczuk M., Gierlik A., Szczepanik D., Nowicka A., Dudek M. R., Cebrat S. 2000, No mystery of ORFans in Genomics - Generation of ORFans in the Antisense of Coding Sequences. The Second International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure, BGRS 7-11 August 2000, Novosybirsk, Russia. Proceedings of the Second International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure vol. 2 pp. 38-41
    [Download]

  6. Mackiewicz P., Szczepanik D., Gierlik A., Stojek E., Dudek M. R., Cebrat S. 2000, One thousand genes less in the yeast genome? The 24th Congress of the Polish Society of Microbiologists 12-15 September 2000, Białystok, Polska. Med. Sci. Monit. 6, Suppl. 3, G/P-1 pp. 151

  7. Nowicka A., Gierlik A., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Dudek M. R., Cebrat S. 2000, Asymmetry of the nucleotide composition of the leading and retarding strand. The 24th Congress of the Polish Society of Microbiologists 12-15 September 2000, Białystok, Polska. Med. Sci. Monit. 6, Suppl. 3, G/P-6 pp. 152

  8. Szczepanik D., Mackiewicz P., Gierlik A., Kowalczuk M., Dudek M. R., Cebrat S. 2000, Dependence of gene evolution rate on location on the chromosome in eubacteria. The 24th Congress of the Polish Society of Microbiologists 12-15 September 2000, Białystok, Polska. Med. Sci. Monit. 6, Suppl. 3, G/P-3 pp. 151

  9. Wróblewska H., Mackiewicz P., Gierlik A., Nowicka A., Dudek M. R., Cebrat S. 2000, Number of genes in prokaryotic genomes. The 24th Congress of the Polish Society of Microbiologists 12-15 September 2000, Białystok, Polska. Med. Sci. Monit. 6, Suppl. 3, C/P-1 pp. 110

1999

  1. Bartkowiak A., Cebrat S., Mackiewicz P. 1999, Some statistical problems arising when investigating DNA sequences. Second European Conference on Highly Structured Stochastic Systems 14-18 September 1999, Pavia, Italy. Book of Abstracts pp. 19-21

  2. Dudkiewicz M., Mackiewicz P., Gierlik A., Kowalczuk M., Nowicka A., Dudek M. R., Cebrat S. 1999, Logic structure of DNA coding sequences. The 13th Max Born Symposium 26-30 May 1999, Wrocław, Polska.

  3. Gierlik A., Kowalczuk M., Mackiewicz P., Wróblewska H., Nowicka A., Dudek M. R., Cebrat S. 1999, Correlation in coding sequences of different genomes. The 13th Max Born Symposium 26-30 May 1999, Wrocław, Polska.

  4. Gierlik A., Kowalczuk M., Mackiewicz P., Szczepanik D., Dudkiewicz M., Dudek M. R., Cebrat S. 1999, Distribution of coding sequences on the surface of torus. The 13th Max Born Symposium 26-30 May 1999, Wrocław, Polska.

  5. Kowalczuk M., Mackiewicz P., Gierlik A., Szczepanik D., Stojek E., Dudek M. R., Cebrat S. 1999, Asymmetry of nucleotide composition of prokaryotic chromosomes. The 13th Max Born Symposium 26-30 May 1999, Wrocław, Polska.

  6. Kowalczuk M., Gierlik A., Mackiewicz P., Dudek M. R., Cebrat S. 1999, Is there replication-associated mutational pressure in the Saccharomyces cerevisiae genome? The 19th International Conference on Yeast Genetics and Molecular Biology 25-30 May 1999, Rimini, Italy. Current Genetics, 35(3-4) pp. 225

  7. Mackiewicz P., Gierlik A., Kowalczuk M., Szczepanik D., Stojek E., Dudek M. R., Cebrat S. 1999, Asymmetry of coding properties of prokaryotic chromosomes. The 13th Max Born Symposium 26-30 May 1999, Wrocław, Polska.

  8. Mackiewicz P., Gierlik A., Kowalczuk M., Dudek M. R., Cebrat S. 1999, How were noncoding ORFs generated in the yeast genome? The 19th International Conference on Yeast Genetics and Molecular Biology 25-30 May 1999, Rimini, Italy. Current Genetics, 35(3-4) pp. 226

  9. Mackiewicz P., Gierlik A., Kowalczuk M., Cieślakiewicz D., Borkowska J., Dudek M. R., Cebrat S. 1999, Graphic representation of coding DNA sequences - spiders and cracknels. The 13th Max Born Symposium 26-30 May 1999, Wrocław, Polska.

  10. Mackiewicz P., Gierlik A., Kowalczuk M., Szczepanik D., Stojek E., Dudek M. R., Cebrat S. 1999, Asymmetry of coding sequences in Borrelia burgdorferi genome. The 13th Max Born Symposium 26-30 May 1999, Wrocław, Polska.

1998

  1. Cebrat S., Gierlik A., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Dudek M. R. 1998, Asymmetry of nucleotide composition of bacterial chromosomes. XIII Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego 22-25 September 1998, Warszawa, Polska. J. Appl. Genet. 39A pp. 155

  2. Cebrat S., Dudek M. R., Gierlik A., Kowalczuk M., Mackiewicz P. 1998, Effect of replication on the third base of codons. The 11th Marian Smoluchowski Symposium on Statistical Physics 1-5 September 1998, Zakopane, Polska.

  3. Fita M., Kowalczuk M., Mackiewicz P., Cebrat S. 1998, Mystery of Orphans revisited. The 6th International Students’ Scientific Conference , Gdańsk, Polska. Book of Abstracts pp. 18

  4. Gierlik A., Borkowska J., Cieślakiewicz D., Cebrat S. 1998, Types of nucleotide substitutions introduced by mutational pressure into coding and noncoding sequences. The 6th International Students’ Scientific Conference , Gdańsk, Polska. Book of Abstracts pp. 18

  5. Gierlik A., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Dudek M. R., Cebrat S. 1998, Is transcription the main reason of asymmetry of DNA molecule? XIII Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego 22-25 September 1998, Warszawa, Polska. J. Appl. Genet. 39A pp. 156

  6. Gierlik A., Nowicka A., Cebrat S. 1998, How replication-associated mutational pressure affect coding and noncoding sequences? The 6th International Students’ Scientific Conference , Gdańsk, Polska. Book of Abstracts pp. 17

  7. Kowalczuk M., Gierlik A., Mackiewicz P., Cebrat S. 1998, Using the effect of mutational pressure for mapping the origin and the terminus of replication of prokaryotic genomes. The 6th International Students’ Scientific Conference , Gdańsk, Polska. Book of Abstracts pp. 3

  8. Kowalczuk M., Mackiewicz P., Dudek M. R., Cebrat S. 1998, The number of protein coding ORFs in Saccharomyces cerevisiae genome. XIII Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego 22-25 September 1998, Warszawa, Polska. J. Appl. Genet. 39A pp. 155

  9. Mackiewicz P., Wiszniowska T. 1998, Thickness and structure of dental enamel in the selected recent and fossil species of mammals. The 6th International Students’ Scientific Conference , Gdańsk, Polska. Book of Abstracts pp. 34

  10. Mackiewicz P., Stojek E., Szczepanik D., Cebrat S. 1998, Aminoacid composition of peptide depends on the location of gene on chromosome. The 6th International Students’ Scientific Conference , Gdańsk, Polska. Book of Abstracts pp. 16

  11. Mackiewicz P., Gierlik A., Kowalczuk M., Dudek M. R., Cebrat S. 1998, How amino acid composition of proteins depends on location of their genes on chromosome? XIII Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego 22-25 September 1998, Warszawa, Polska. J. Appl. Genet. 39A pp. 156

  12. Mackiewicz P., Dudek M. R., Cebrat S. 1998, Statistical significance of the asymmetry introduced by mutational pressure. The 6th International Students’ Scientific Conference , Gdańsk, Polska. Book of Abstracts pp. 17

  13. Schneider J., Cebrat S., Stauffer D. 1998, Why do women live longer than men? A monte Carlo simulation of Penna models with X and Y chromosomes. The 5th International Conference Mathematical Population Dynamics , Zakopane, Polska.

1997

  1. Cebrat S., Dudek M. R., Mackiewicz P. 1997, The number of coding ORFs in Saccharomyces cerevisiae genome and the mystery of orphans. The 18th Int. Conf. Yeast Genetics Mol. Biol. , Stellenbosch, South Africa. Yeast 13, S262

  2. Cebrat S., Dudek M. R. 1997, Compensation of coding trends in yeast genome. Middle European Cooperation in Statistical Physics April 1997, Szklarska Poręba, Polska.

  3. Cebrat S., Dudek M. R., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Fita M. 1997, Asymmetry of coding versus noncoding strands of protein coding sequences. The 9th International Genome Sequencing and Analysis Conference 13-16 September 1997, Hilton Head, USA.

  4. Cebrat M., Kanczewska J., Cebrat S. 1997, The role of silent mutations in CpG sequences in the human p53 gene. The 5th International Students’ Scientific Conference , Gdańsk, Polska. Book of Abstracts pp. 23

  5. Fita M., Kowalczuk M., Mackiewicz P., Cebrat S. 1997, Estimation of the number of genes in the yeast genome - the explanation of the paradox of orphans. The 5th International Students’ Scientific Conference , Gdańsk, Polska. Book of Abstracts pp. 25

  6. Kowalczuk M., Fita M., Mackiewicz P., Cebrat S. 1997, The asymmetry of the sense versus antisense strands of coding sequences in Saccharomyces cerevisiae genome. The 5th International Students’ Scientific Conference , Gdańsk, Polska. Book of Abstracts pp. 8

  7. Mackiewicz P., Kowalczuk M., Fita M., Cebrat S. 1997, Have genes generated new genes in antisense? The 5th International Students’ Scientific Conference , Gdańsk, Polska. Book of Abstracts pp. 34

1996

  1. Cebrat S., Dudek M. R. 1996, Symmetry in chromosome fractal organization and DNA domain structure. The 8th Joint EPS-APS Int. Conference on Physics Computing 17-21 September 1996, Kraków, Polska. Proceedings of the 8th Joint EPS-APS Int. Conference on Physics Computing pp. 371-374

  2. Cebrat S., Dudek M. R. 1996, Symmetry in DNA domains of Yeast Chromosomes. The 8th Joint EPS-APS Int. Conference on Physics Computing 17-21 September 1996, Kraków, Polska.

1995

  1. Cebrat S., Maliszewska-Fiszer Ł. 1995, Mutacje somatyczne w genie p53 człowieka. XII Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego , Szczecin, Polska. J. Appl. Genet. 36A pp. 153

  2. Cebrat S., Dudek M. R. 1995, Klasyfikacja otwartych ramek odczytu. XII Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego , Szczecin, Polska. J. Appl. Genet. 36A pp. 24

  3. Cebrat S., Dudek M. R. 1995, Analiza korelacji dalekozasięgowych w sekwencjach chromosomów drożdżowych. XII Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego , Szczecin, Polska. J. Appl. Genet. 36A pp. 25

0

Pliki Cookies

Meritum

Archive