Seminars in SmORFland

Department's meetings are held every Tuesday at 12.15 pm. Everybody interested in problems discussed during seminars is cordially invited. Anybody who wants to present his own problem or results is encouraged to contact Paweł Mackiewicz -> mailto:%20pamac [snail] smorfland [period] uni [period] wroc [period] pl or anybody from SmORFland team, to fix his talk in the schedule.
Seminars are in Polish but even for one English speaking guest we are going to switch to English.


All Seminars


  1. "Zróżnicowanie w liczbie i długości intronów w genomach"
    Wojciech Soboń
    May 25 2017, 12:45 pm

  2. "Properties of doubtful amyloids"
    Michał Burdukiewicz
    May 15 2017, 12:30 pm

  3. "Problem supresji rekombinacji w ewolucji chromosomów płci"
    Dorota Mackiewicz
    March 27 2017, 12:30 pm

  4. "Optimal reduced alphabets revealed by genetic algorithms"
    Michał Burdukiewicz
    March 13 2017, 12:30 pm

  5. "The impact of the alphabet reduction on the signal peptide prediction using signalP 4.1"
    Michał Burdukiewicz
    February 27 2017, 11:00 am

  6. "Nowe poglądy na temat powstania kodu genetrycznego"
    Paweł Mackiewicz
    January 31 2017, 12:00 pm

  7. "Proces rekombinacji a degeneracja chromosomu Y"
    Dorota Mackiewicz
    January 24 2017, 12:00 pm

  8. "Skazani na degenerację – słów kilka o ewolucji chromosomów płci"
    Dorota Mackiewicz
    January 17 2017, 11:30 am

  9. "Kody alternatywne - kontynuacja"
    Paweł Błażej
    December 13 2016, 12:00 pm

  10. "The Mechanisms of Codon Reassignments in Mitochondrial Genetic Codes"
    Małgorzata Wnętrzak
    December 6 2016, 12:00 pm

  11. "A Unified Model of Codon Reassignment in Alternative Genetic Codes"
    Małgorzata Wnętrzak
    November 29 2016, 12:00 pm

  12. "Alternatywne kody genetyczne"
    Paweł Błażej
    November 22 2016, 12:00 pm

  13. "Aggregation on leash: inhibition of amyloid aggregation"
    Michał Burdukiewicz
    November 8 2016, 12:15 pm

  14. "Odtwarzanie drzewa życia"
    Aleksander Czeszyk
    September 9 2016, 10:00 am

  15. "Prediction of amyloidogenicity based on the n-gram analysis"
    Michał Burdukiewicz
    September 9 2016, 11:00 am

  16. "Prediction of amyloidogenicity based on the n-gram analysis"
    Michał Burdukiewicz
    July 11 2016, 12:00 pm

  17. "Filogeneza Bruzdnic"
    Damian Kacperski
    July 1 2016, 10:00 am

  18. "Prediction of biological sequence properties based on n-gram analysis, part 2"
    Michał Burdukiewicz
    June 27 2016, 12:00 pm

  19. "Zróżnicowanie w liczbie i długości intronów w aspekcie ewolucji genów"
    Wojciech Soboń
    June 20 2016, 12:00 pm

  20. "Prediction of biological sequence properties based on n-gram analysis"
    Michał Burdukiewicz
    June 13 2016, 12:00 pm

  21. "The Red Queen theory of recombination hotspots"
    Joanna Ziobro (Zmiana daty)
    June 6 2016, 12:00 pm

  22. "Prediction of amyloidogenicity based on the n-gram analysis"
    Michał Burdukiewicz
    May 23 2016, 12:00 pm

  23. "Zastosowanie nauk biologicznych w kryminalistyce"
    Elżbieta Dziadyk
    May 9 2016, 12:00 pm

  24. "Predicting malarial signal peptides with signalHsmm"
    Michał Burdukiewicz
    April 25 2016, 12:00 pm

  25. "Limitation of tuning the antibody-antigen reaction by changing the value of pH and its consequence for hyperthermia"
    Joanna Ziobro
    March 21 2016, 12:00 pm

  26. "Dlaczego mutacje synonimiczne nie zawsze są neutralne?"
    Dorota Mackiewicz
    March 7 2016, 12:00 pm

  27. "biogram: N-Gram Analysis of Biological Sequences"
    Michał Burdukiewicz
    January 25 2016, 10:30 am

  28. "The impact of selection at the amino acid level on synonymous codon usage - computer simulation studies"
    Paweł Błażej
    January 11 2016, 10:30 am

  29. "Identification of regional structure in signal peptides"
    Michał Burdukiewicz (Zmiana daty)
    December 21 2015, 10:30 am

  30. "Detection of premature stop codons"
    Małgorzata Grabińska
    November 30 2015, 10:30 am

  31. "Selection at the amino acid level can influence synonymous codon usage: implications for the study of codon adaptation in plastid genes. "
    Paweł Błażej
    November 23 2015, 10:30 am

  32. "Ryzyko mutacji a skład nukleotydowy genów"
    Ewa Misiak
    November 9 2015, 10:00 am

  33. "Evolution of Toc34 and Toc159 receptors recognizing plastid transit peptides"
    Michael Nikiel
    November 5 2015, 10:30 am

  34. "Signal peptides of Apicomplexa"
    Michał Burdukiewicz
    October 19 2015, 10:00 am

  35. "biogram: a toolkit for n-gram analysis"
    Michał Burdukiewicz
    September 14 2015, 10:00 am

  36. "Analiza filogenetyczna mikroorganizmów glebowych uzyskanych z MDRS."
    Agnieszka Rumińska
    September 14 2015, 11:00 am

  37. "Optymalizacja kodu genetycznego"
    Szymon Faliński
    September 7 2015, 10:00 am

  38. "Poszukiwanie sekwencji ortologicznych"
    Liliana Sokół
    September 4 2015, 13:00 pm

  39. "Znaczniki epigenetyczne i ich dziedziczenie"
    Aleksander Czeszyk
    September 2 2015, 11:00 am

  40. "Zróżnicowane losy genów - proces pseudogenizacji"
    Wojciech Soboń
    August 24 2015, 11:00 am

  41. "Expanding signalHsmm using n-grams"
    Michał Burdukiewicz i Piotr Sobczyk
    July 6 2015, 09:30 am

  42. "n-gram models in sequence comparisions"
    Michał Burdukiewicz
    June 29 2015, 09:15 am

  43. "Monoalleliczna ekspresja genów"
    Agata Hnitecka
    June 8 2015, 09:30 am

  44. "Zastosowanie narzędzi bioinformatycznych w genomice nowotworów"
    Kamila Żełobowska
    June 1 2015, 09:30 am

  45. "Krótkie życie gorących miejsc rekombinacji"
    Marta Igras
    May 18 2015, 09:30 am

  46. "Encodings of amino acids and their impact on signal peptide prediction"
    Michał Burdukiewicz
    May 11 2015, 11:30 am

  47. "One hundred new universal exonic markers for birds developed from a genomic pipeline"
    Aleksandra Kroczak
    May 4 2015, 09:30 am

  48. "Algorytm EM - wprowadzenie"
    Paweł Błażej
    April 27 2015, 09:30 am

  49. "Stepwise n-gram building"
    Michał Burdukiewicz, Piotr Sobczyk
    April 20 2015, 09:15 am

  50. "Signal.hsmm and biogram on posters"
    Michał Burdukiewicz, Piotr Sobczyk
    April 8 2015, 12:15 pm

  51. "Quick Permutation Test"
    Michał Burdukiewicz, Piotr Sobczyk
    February 25 2015, 12:45 pm

  52. "Wpływ metod i wyboru markerów molekularnych na odtwarzane relacje filogenetyczne między papugami z grupy Arini"
    Paweł Mackiewicz
    February 23 2015, 10:30 am

  53. "Poszukiwanie skutecznych markerów genetycznych do analiz filogenetycznych różnych grup papug (Psittaciformes) - sekwencjonowanie"
    Aleksandra Kroczak
    February 9 2015, 10:30 am

  54. "Eukaryotic signal peptides and prediction of their cleavage sites"
    Michał Burdukiewicz, Piotr Sobczyk
    February 2 2015, 10:30 am

  55. "Multiwyszukiwarki w bioinformatyce"
    Michał Burdukiewcz (Zmiana godziny)
    January 28 2015, 12:00 pm

  56. "Od darwinizmu do ultradarwinizmu i symbiogenezy"
    Przemysław Gagat
    January 21 2015, 12:45 pm

  57. "Symulowanie ewolucji kodu genetycznego"
    Paweł Błażej i Małgorzata Wnętrzak
    January 19 2015, 10:30 am

  58. "Protein import into thylakoids of Paulinella chromatophora"
    Przemysław Gagat
    January 12 2015, 10:30 am

  59. "Czy istnieje życie po życiu? – problem funkcjonalnych pseudogenów (cd)"
    Dorota Mackiewicz
    December 17 2014, 12:45 pm

  60. "Czy istnieje życie po życiu? – problem funkcjonalnych pseudogenów"
    Dorota Mackiewicz
    December 10 2014, 12:45 pm

  61. "Ewolucja chromosomów płci"
    Piotr Posacki
    December 8 2014, 10:30 am

  62. "Poszukiwanie skutecznych markerów genetycznych do analiz filogenetycznych różnych grup papug (Psittaciformes)"
    Aleksandra Kroczak
    December 1 2014, 10:00 am

  63. "Przegląd teorii dotyczących pochodzenia i ewolucji kodu genetycznego"
    Małgorzata Wnętrzak
    November 24 2014, 10:00 am

  64. "Prediction of cleavage sites in signal peptides using Quick Information Test"
    Michał Burdukiewicz i Piotr Sobczyk
    November 17 2014, 10:00 am

  65. "Analiza ekstremofilnych mikroorganizmów glebowych występujących na analogu ziemi marsjańskiej (MDRS)"
    Agnieszka Rumińska
    November 3 2014, 10:15 am

  66. "Predicting signal peptides using hidden semi-Markov models"
    Michał Burdukiewicz, Piotr Sobczyk
    September 25 2014, 10:00 am

  67. "Ewolucja systemów transportu białek w plastydach pierwotnych i chromatoforach Paulinella"
    Przemysław Gagat
    September 11 2014, 12:00 pm

  68. "Konflikt replikacja-transkrypcja a ewolucja"
    Małgorzata Grabińska
    September 9 2014, 10:00 am

  69. "Ewolucja chromosomów płci - cd."
    Piotr Posacki
    June 16 2014, 09:00 am

  70. "Wielokrotne HMM w predykcji lokalizacji subkomórkowej"
    Michał Burdukiewicz i Piotr Sobczyk (Zmieniono datę semianrium na poprawną.)
    June 5 2014, 09:30 am

  71. "Zastosowanie algorytmu BLAST jako narzędzia selekcji na poziomie produktu translacji"
    Małgorzata Grabińska
    June 2 2014, 09:00 am

  72. "Sztuczna presja mutacyjna - optymalizacja wielokryterialna"
    Paweł Błażej
    May 26 2014, 08:30 am

  73. "Ewolucja systemów transportu białek w plastydach pierwotnych i chromatoforach Paulinella"
    Przemysław Gagat
    May 14 2014, 08:00 am

  74. "Krótkie życie gorących miejsc rekombinacji"
    Marta Igras
    May 12 2014, 09:00 am

  75. "Ewolucja chromosomów płci"
    Piotr Posacki
    May 5 2014, 09:00 am

  76. "Wykrywanie peptydów sygnałowych przy użyciu HMM"
    Michał Burdukiewicz i Piotr Sobczyk
    April 24 2014, 10:00 am

  77. "Ewolucja chromosomu Y i jej konsekwencje"
    Dorota Gawlik
    April 16 2014, 12:00 pm

  78. "Szukanie macierzy substytucji nukleotydowych przy użyciu ortologów"
    Małgorzata Grabińska
    April 10 2014, 10:00 am

  79. "Predykcja lokalizacji subkomórkowej"
    Michał Burdukiewicz, Piotr Sobczyk
    February 17 2014, 12:00 pm

  80. "Uwagi na temat szacowania presji mutacyjnej"
    Pawel Blazej
    November 27 2013, 10:00 am

  81. "Algorytm Metropolisa-Hastingsa jako presja selekcyjna"
    Małgorzata Grabińska
    November 20 2013, 11:00 am

  82. "Generowanie długich otwartych ramek odczytu w genomach prokariotycznych"
    Krystian Bączkowski
    October 3 2013, 09:00 am

  83. "Wykorzystanie sztucznych sieci neuronowych i algorytmu genetycznego do badania proteomów"
    Maciej Sobczyński
    October 3 2013, 10:00 am

  84. "Czy presja mutacyjna jest zoptymalizowana? "
    Błażej Miasojedow
    September 25 2013, 12:00 pm

  85. "Zastosowanie algorytmu Metropolisa-Hastingsa w symulowaniu ewolucji genomu prokariotycznego"
    Małgorzata Grabińska
    September 19 2013, 10:30 am

  86. "Czy używalność kodonów w genomie B. burgdorferi jest optymalna?"
    Paweł Błażej
    September 5 2013, 11:00 am

  87. "Jak generować łańcuchy Markowa metodami symulacyjnymi ?"
    Małgorzata Grabińska
    July 22 2013, 10:00 am

  88. "Symulacje ewolucji rekombinacji chromosomów płci"
    Piotr Posacki
    July 9 2013, 10:30 am

  89. "Przegląd i mataanaliza danych o zdrowiu dzieci poczętych in vitro"
    Piotr Posacki
    July 1 2013, 10:30 am

  90. "Właściwości macierzy substytucji nukleotydowych"
    Małgorzata Grabińska
    June 24 2013, 10:00 am

  91. "Macierze substytucji nukleotydowych"
    Małgorzata Grabińska
    June 17 2013, 10:00 am

  92. "Ukryte łańcuchy Markowa"
    Piotr Sobczyk
    January 10 2013, 10:30 am

  93. "Ukryte łańcuchy Markowa"
    Piotr Sobczyk
    December 13 2012, 10:30 am

  94. "Częstość występowania wybranych chorób u dzieci poczętych metodą in vitro"
    Piotr Posacki
    November 22 2012, 10:30 am

  95. "Analiza funkcjonalna regionów sąsiadujących z klastrami genów receptorów węchowych"
    Natalia Pietraszewska
    October 25 2012, 10:30 am

  96. "Sztuczna presja mutacyjna"
    Paweł Błażej
    October 10 2012, 09:00 am

  97. "Komputerowe modelowanie zjawisk towarzyszących komplementacji haplotypów"
    Wojciech Waga (Powtórka z poprzedniego tygodnia.)
    May 28 2012, 11:30 am

  98. "Komputerowe modelowanie zjawisk towarzyszących komplementacji haplotypów"
    Wojciech Waga
    May 21 2012, 11:30 am

  99. "Pewna modyfikacja algorytmu ewolucyjnego oraz jego zastosowania"
    Paweł Błażej
    May 7 2012, 11:30 am

  100. "Ewolucja genomu bakteryjnego i metody uzyskiwania macierzy substytucji nukleotydowych"
    Małgorzata Wańczyk
    April 23 2012, 11:30 am

  101. "TagSNP selection based on bovine microarray data"
    Adrian Drożdż
    February 27 2012, 11:30 am

  102. "Symulowanie ewolucji genomu prokariotycznego - nowe wyniki"
    Paweł Błażej
    February 13 2012, 11:30 am

  103. "How to deal with small Open Reading Frames?"
    Małgorzata Wańczyk
    January 20 2012, 10:00 am

  104. "Zaburzenia mejozy a aberracje chromosomowe"
    Piotr Posacki
    January 13 2012, 10:00 am

  105. "Symulacje ewolucji na siatce"
    Wojciech Waga
    December 2 2011, 10:00 am

  106. "Algorithms for modeling of the evolution of complex stochastic genetic systems"
    Tomasz Wojdyła (Politechnika Śląska)
    November 25 2011, 12:00 pm

  107. "Evolution of the endomembrane system-mediated protein targeting to the plastids with two envelope membranes"
    Przemysław Gagat
    November 18 2011, 09:00 am

  108. "Zastosowanie łańcuchów Markowa do wykrywania sekwencji kodujących białko "
    Patrycja Białowąs
    October 28 2011, 09:00 am

  109. "Development of distinct colonies of genotype in a sympatric model of diploid entities"
    Robert Puddicombe (Department of Computing, University of Surrey, Guildford, Surrey, GU2 7XH, UK)
    October 18 2011, 11:00 am

  110. "Modelowanie ewolucji genomu"
    Małgorzata Wańczyk
    October 11 2011, 10:00 am

  111. "Symulacje ewolucji populacji ze zmienną częstością mutacji"
    Piotr Posacki
    October 4 2011, 10:00 am

  112. "Klasyfikacja krótkich ORFów - wyniki"
    Paweł Błażej, Małgorzata Wańczyk
    April 21 2011, 10:45 am

  113. "Czy nowe odczytanie współczynnika inbredu uwzględniające zawartość rodowodów ma sens?"
    Iwona Głażewska
    April 14 2011, 10:45 am

  114. "Modelowanie efektów genów zlokalizowanych na chromosomie szóstym Bos taurus jako zmiennych w czasie przy użyciu modeli mieszanych z regresjami losowymi"
    Tomasz Suchocki
    March 31 2011, 10:45 am

  115. "Modelowanie ewolucji genomu"
    Paweł Błażej
    March 17 2011, 10:00 am

  116. "Tempo ewolucji ludzkich genów w aspekcie ich położenia względem telomeru"
    Dorota Mackiewicz
    March 9 2011, 10:00 am

  117. "Application of SNP chips in the estimation of genetic value in dairy cattle"
    Kacper Żukowski
    March 3 2011, 10:00 am

  118. "Symulacje rozwoju populacji z zapłodnieniem pozaustrojowym"
    Piotr Posacki
    February 17 2011, 10:00 am

  119. "Jak kierowane są białka do nowo nabytego plastydu? Przykład Paulinella chromatophora"
    Paweł Mackiewicz
    February 10 2011, 10:00 am

  120. "Wybór tagSNP z bydlęcej macierzy SNP - zebrane wyniki"
    Adrian Drożdż
    February 3 2011, 10:00 am

  121. "Zależności pomiędzy ewolucją różnych chromosomów"
    Wojciech Waga
    January 27 2011, 10:00 am

  122. "Klasyfikacja krótkich ORFów oraz modelowanie ewolucji genomu"
    Paweł Błażej
    January 20 2011, 10:00 am

  123. "W jaki sposób wyewoluował transport pęcherzykowy do plastydów pierwotnych?"
    Przemysław Gagat
    January 13 2011, 10:00 am

  124. "Samoorganizacja punktów rekombinacji na chromosomach - modelowanie"
    Dorota Mackiewicz
    November 18 2010, 10:00 am

  125. "Żyj szybko, umieraj młodo, czyli kilka słów o gorących miejscach rekombinacji"
    Dorota Mackiewicz
    November 4 2010, 10:00 am

  126. "Ukryte łańcuchy Markowa"
    Paweł Błażej
    October 28 2010, 10:00 am

  127. "Zastosowanie łańcuchów Markowa na przykładzie algorytmu GeneMark"
    Małgorzata Wańczyk
    October 21 2010, 10:00 am

  128. "Symulacje ewolucji genomu człowieka"
    Wojciech Waga
    January 7 2010, 11:30 am

  129. "Analiza grubości szkliwa zębów kopalnych gatunków niedźwiedzi"
    Paweł Mackiewicz
    December 17 2009, 11:30 am

  130. "Metoda klasyfikacji ORFów - ciąg dalszy"
    Paweł Błażej
    November 26 2009, 11:30 am

  131. "Ewolucja i filogeneza białek Rab7 i Rab9"
    Paweł Mackiewicz
    November 19 2009, 11:30 am

  132. "Algorytmy aproksymacyjne: Problem najkrótszego wspólnego nadsłowa"
    Grzegorz Hermanowicz
    November 5 2009, 11:30 am

  133. "Rola transportu pęcherzykowego w imporcie białek do plastydów pierwotnych"
    Przemysław Gagat
    October 29 2009, 11:30 am

  134. "Nie taka nowa metoda klasyfikacji ORFów"
    Paweł Błażej
    October 22 2009, 11:30 am

  135. "Samoorganizacja częstości i rozkładu rekombinacji w chromosomach eukariotycznych"
    Stanisław Cebrat
    October 14 2009, 11:30 am

  136. "Modelowanie ewolucji polimorficznych loci"
    Stanisław Cebrat
    October 7 2009, 11:30 am

  137. "Nowa metoda klasyfikacji ORFów"
    Paweł Błażej
    May 14 2009, 10:30 am

  138. "News from the RNA World"
    Peter F. Stadler
    April 9 2009, 15:00 pm

  139. "Plastydy złożone a dysmutazy ponadtlenkowe"
    Paweł Mackiewicz
    March 18 2009, 10:30 am

  140. "Wybór tagSNP na podstawie danych pochodzących z bydlęcych mikromacierzy SNP"
    Adrian Drożdż
    February 5 2009, 10:30 am

  141. "Modelowanie efektów genów zlokalizowanych na chromosomie 6tym Bostaurus jako zmiennych w czasie, przy użyciu modeli mieszanych z regresjami losowymi"
    Tomasz Suchocki
    January 29 2009, 10:30 am

  142. "Wykorzystanie informacji pochodzącej z mikromacierzy SNP w ocenie genetycznej bydła mlecznego"
    Kacper Żukowski
    January 22 2009, 10:30 am

  143. "Recombination rate and genes distribution on human chromosomes"
    Dorota Mackiewicz
    December 18 2008, 10:30 am

  144. "A few remarks on evolution with spatial measures"
    Wojciech Waga
    December 11 2008, 10:30 am

  145. "Phase transitions for panmictic populations"
    Marta Zawierta
    November 27 2008, 10:30 am

  146. "Marker selection using combined methods based on HapMap and Genbank databases"
    Adrian Drożdż and Joanna Szyda
    November 13 2008, 10:30 am

  147. "Amino acid composition of proteins as a function of environmental factors"
    Maciej Sobczyński
    November 6 2008, 10:30 am

  148. "Evolution of complex plastids"
    Paweł Mackiewicz
    October 23 2008, 10:30 am

  149. "From genomes' coding capacity analyses to modeling the evolution"
    Stanisław Cebrat
    October 9 2008, 10:00 am

Pliki Cookies

Meritum

Archive

Webmail SQ

Webmail RC

Owncloud